大熊猫基因组BAC文库及Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建的任务书.docx

大熊猫基因组BAC文库及Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建的任务书
任务书
项目名称：大熊猫基因组BAC文库及Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建
一、项目背景及意义：
大熊猫是我国珍稀、濒危的动物物种之一，也是中国唯一的一种熊科动物。随着现代生物学技术的不断发展和普及，对大熊猫的基因组研究已成为一项十分重要的任务。其中，建立大熊猫基因组BAC文库及Ⅱ类MHC基因组物理图谱是探究大熊猫基因组结构与功能的重要方向。此外，大熊猫Ⅱ类MHC基因具有重要的免疫调节功能，对于熊猫的免疫保护和疾病防控具有重要意义。
本项目旨在建立大熊猫基因组BAC文库和Ⅱ类MHC基因组物理图谱，为熊猫基因组研究提供重要的工具和理论支持，为保护熊猫和探究其生物学特性提供重要的科学依据。
二、任务目标：
1.建立大熊猫基因组BAC文库：收集大熊猫植物质、血液、组织等DNA样品，建立大熊猫基因组BAC文库，构建500倍以上的DNA文库。
2.大熊猫基因组物理图谱构建：基于已建立的大熊猫基因组BAC文库，通过BAC亚克隆、DNA测序和物理映射等方法，构建大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱，确定Ⅱ类MHC基因的分布和排列情况。
3.Ⅱ类MHC基因功能研究：对大熊猫Ⅱ类MHC基因进行序列分析和功能研究，探究其在熊猫免疫调控和抗病机制中的作用，为大熊猫保护和疾病控制提供科学依据。
三、任务分工：
1.样品采集及DNA提取：由野生动物保护机构提供大熊猫血液、组织等样品，由生物学研究人员进行样品的DNA提取和纯化。
2.大熊猫基因组BAC文库建立：由基因组学研究团队负责，采用BAC亚克隆技术建立大熊猫基因组BAC文库，并对文库进行质检和测序。
3.大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建：由基因组学和生物信息学研究团队共同负责，采用生物信息学和物理映射等方法，构建大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱，并测定Ⅱ类MHC基因的分布和排列情况。
4.Ⅱ类MHC基因序列分析和功能研究：由分子生物学和免疫学研究团队共同负责，对大熊猫Ⅱ类MHC基因进行序列分析和功能研究，探究其在熊猫免疫调控和抗病机制中的作用。
四、研究方案：
1.样品采集及DNA提取：采用先进的分离纯化技术，对大熊猫血液、组织样品进行DNA提取，保证DNA质量和纯度。
2.大熊猫基因组BAC文库建立：根据大熊猫基因组大小和预估的BAC片段覆盖率，制备合适的文库，并通过筛选、文库扩增、存储等步骤完成文库建立。
3.大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建：通过BAC亚克隆和测序技术，进行大熊猫基因组BAC文库的亚克隆和测序，获得BAC片段序列，根据这些片段序列，利用物理映射技术构建大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱。
4.Ⅱ类MHC基因序列分析和功能研究：根据已有的序列和相应的分析工具，对大熊猫Ⅱ类MHC基因进行序列分析和功能研究，包括基因家族、编码蛋白质的结构、功能区域、多态性等，揭示其在熊猫免疫调控和抗病机制中的作用。
五、项目预期成果：
1.成功建立大熊猫基因组BAC文库，构建500倍以上的DNA文库；成功构建大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱，确定Ⅱ类MHC基因的分布和排列情况。
2.对大熊猫Ⅱ类MHC基因进行序列分析和功能研究，揭示其在熊猫免疫调控和抗病机制中的作用。
3.源于本项目的科学成果将推动我国珍稀动物基因组学、生物多样性研究等领域重要科学问题的探究，为我国大熊猫保护和疾病控制提供重要科学依据。
六、预算及时间安排：
1.预算：本项目总预算为1000万元人民币。
2.时间安排：本项目计划为期3年，具体时间安排如下：
第一年：完成样品采集、DNA提取和大熊猫基因组BAC文库建立。
第二年：完成大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱构建。
第三年：完成Ⅱ类MHC基因序列分析和功能研究，并对项目成果进行总结和报告。
七、风险评估及应对策略：
1.野生动物保护法律法规：样品采集需要与野生动物保护部门进行充分沟通协调，遵守国家相关法律法规。
2.项目进度受到不可抗力因素影响：如天气恶劣，相关设备故障等情况，将采取加班加点、延迟计划等措施，确保项目进度不受影响。
3.数据质量问题：加强数据质控及评估，确保获得准确、可靠的数据，根据实际情况进行修改和调整。
八、项目执行者：
项目执行者为一支由基因组学、生物信息学、分子生物学和免疫学专家组成的团队，由团队负责人领导，协同完成项目任务，并对项目成果进行总结和报告。同时，团队成员需与野生动物保护部门等相关部门进行配合和沟通，保证项目进展和成果顺利完成。