过敏性紫癜患儿高通量测序肠道菌群结果的分析的任务书.docx

过敏性紫癜患儿高通量测序肠道菌群结果的分析的任务书
任务书：过敏性紫癜患儿高通量测序肠道菌群结果分析
背景介绍：
过敏性紫癜是一种儿童常见的自限性血管性炎症疾病，患者表现为皮下或皮肤内出血瘀斑、关节疼痛、腹泻等。有研究表明，肠道菌群失调可能是过敏性紫癜的发生机制之一。
高通量测序技术可以帮助我们快速、准确地分析肠道微生物群落结构和功能，为寻找过敏性紫癜患者的肠道菌群变化提供很好的方法。
任务目的：
本次任务旨在通过分析过敏性紫癜患儿与健康儿童的肠道菌群高通量测序结果，揭示肠道微生物群落组成的差异，并探寻与过敏性紫癜发生的关联性，为寻找过敏性紫癜的预防和治疗提供参考。
任务内容：
1.数据获取
在国内常用的高通量测序平台如MGISEQ-2000、NovaSeq6000等上进行过敏性紫癜患儿肠道菌群高通量测序，获取其肠道菌群组成。
2.数据清洗和质控
对测序结果进行过滤、去除低质量序列、嵌合体等噪声序列，并评估测序质量，过滤掉无法信任的序列。
3.肠道菌群组成分析
将测序得到的序列比对至各种微生物数据库（如Greengenes、SILVA、NCBI等），对测序结果进行物种分类，分析患儿及健康儿童的菌群组成与丰富度、多样性指数等。
4.差异分析
通过比较过敏性紫癜患儿与健康儿童的肠道菌群组成，寻找菌群的差异，利用计算机算法分析富集指数、稳定性指数、PCoA图等，寻找群落差异并进行验证以及功能分析。
5.功能分析
基于菌群的分类信息，利用功能注释数据库（如KEGG、COG、EC等）进行菌群功能分析，比较不同类型肠道菌群的差异性。
6.结果展示与数据分析
对分析结果进行可视化处理，包括图表、统计分析、深入的富集路径分析，提供标准的、清晰的结果报告。
任务要求：
1.熟练掌握高通量测序相关技术，具备相关数据分析基础。
2.熟练掌握相关分析软件和数据库（包括但不限于Qiime、R、STAMP、MetaStats、picrust等）。
3.具备学科交叉的综合思维和问题解决能力，尤其是在生物学、生态学、计算机科学和数据分析等领域之间。
4.能够在规定时间内完成数据清洗、质控、菌群组成分析、差异分析、功能分析等，并可提出合理的建议和可行性方案。
5.具有良好的团队协作精神和沟通能力，能够与其他团队成员合作一起完成此项任务。
任务执行期限：
60天
总结：
通过对过敏性紫癜患儿与健康儿童的肠道菌群高通量测序结果的分析，可以揭示肠道微生物群落结构的差异性，并进一步探寻肠道菌群与过敏性紫癜之间的关联性。这项研究可为预防和治疗过敏性紫癜提供重要的参考价值。