长非编码RNA种属特异性加工定位机制及功能的研究的任务书.docx

长非编码RNA种属特异性加工定位机制及功能的研究的任务书
任务书
一、项目背景
非编码RNA（Non-codingRNA,ncRNA）是指那些在转录和翻译过程中不被翻译为蛋白质的RNA分子。在过去的几十年中，随着RNA测序技术的不断发展，越来越多的ncRNA被发现并研究。ncRNA在细胞发育、分化、增殖、凋亡等生理过程中扮演着重要的角色。而长非编码RNA（LongNon-codingRNA,lncRNA）是指长度大于200个核苷酸的ncRNA分子，是近年来受到广泛关注的研究领域之一。
与短ncRNA相比，lncRNA的双链区域更长，进而为其提供了更多的功能区域，这也使得lncRNA能够在基因表达、染色质结构、细胞周期调控、细胞分化等过程中发挥重要的作用。但是，与蛋白质编码基因的研究不同，lncRNA的功能机理目前还没有得到充分的解释，这也给多学科的研究提出了挑战。
本项目的研究对象是长非编码RNA的种属特异性加工定位机制及功能。该研究旨在深入探究lncRNA的诱导表达、翻译抑制、调控转录等方面的机理，为lncRNA的临床应用提供理论基础。
二、项目具体内容和目标
1.分析lncRNA的种属特异性
目标：筛选出一批在特定种属中存在的lncRNA，并发掘其在该种属中的表达特点。
内容：
（1）通过数据库挖掘筛选出一批在某特定种属中存在的lncRNA序列，包括已有研究发现的和新发现的。
（2）利用RNA测序技术，分析这批lncRNA在该特定种属中的表达模式和表达水平，并与其他种属进行比较。
（3）进一步寻找这批lncRNA的下游靶基因，分析它们在该特定种属中的表达规律。
2.阐明lncRNA的加工定位机制
目标：阐明lncRNA在RNA加工过程中的特殊加工定位机制，包括剪接、修饰、核糖体组装等方面，并探究其中的分子机理。
内容：
（1）通过RNA测序技术和核苷酸分析等方法，深入研究在该特定种属中存在的lncRNA在RNA加工过程中的剪接、修饰等细节，并与其他物种进行比较研究。
（2）分析lncRNA特殊的结构与功能之间的关系，探究它们在RNA加工过程中的分子机理。
（3）研究lncRNA与某些蛋白质和核酸之间的相互作用，探究这些相互作用对lncRNA加工和定位的影响。
3.探究lncRNA的功能机理
目标：探究lncRNA在转录调控、翻译抑制等方面的功能机理，并探究与这些功能有关的分子机理。
内容：
（1）研究lncRNA与转录因子、染色质重塑因子以及其他参与基因调控的蛋白质之间的相互作用机制。
（2）研究lncRNA与上下游基因表达的调控关系，探究其在细胞分化和增殖等生理过程中的作用机理。
（3）研究lncRNA对翻译的影响机制，探究lncRNA在细胞翻译调控中的作用机理。
三、项目意义和创新性
本项目的研究对象是长非编码RNA的种属特异性加工定位机制及功能。该研究旨在深入探究lncRNA的诱导表达、翻译抑制、调控转录等方面的机理，为lncRNA的临床应用提供理论基础。
本项目的研究内容在以下几个方面具有创新性：
（1）全面深入地探究了lncRNA在某种特定物种中的表达模式和表达水平。
（2）阐明了lncRNA在RNA加工中的特殊加工定位机制，并探究了其中的分子机理。
（3）探究了lncRNA在转录调控、翻译抑制等方面的功能机理，并探究了与这些功能有关的分子机理。
四、项目研究方法与技术路线
1.实验手段：
RNA测序技术、核苷酸分析、质谱分析、分子克隆技术、细胞培养和转染技术等。
2.技术路线：
（1）筛选出种属特异性的lncRNA序列，并进行RNA测序确定其表达模式和表达水平。
（2）通过核苷酸分析对lncRNA进行结构鉴定和加工定位机制探究。
（3）采用质谱分析等手段探究lncRNA和相关蛋白质、RNA之间的相互作用机制。
（4）利用细胞培养和转染技术探究lncRNA在转录调控、翻译抑制等方面的功能机理。
五、预期成果
1.发表一篇高水平论文。
2.对lncRNA种属特异性加工定位机制及功能的研究进行深入探究，为lncRNA及其临床应用提供理论基础。
3.培养一批高水平的学术研究人才，促进相关领域的发展。
六、经费预算
1.实验耗材费：300万
2.实验设备费：100万
3.人员支持费：300万
4.其他费用：100万
总预算为800万。
七、参考文献
1.RinnJL,ChangHY.GenomeregulationbylongnoncodingRNAs.Annualreviewofbiochemistry,2012,81:145-166.
2.HuarteM.TheemergingroleoflncRNAsincancer.Naturemedicine,2015,21(11):1253-1261.
3.SunM,Krau