SRBSDV侵染后水稻miRNA表达的差异研究的任务书.docx

SRBSDV侵染后水稻miRNA表达的差异研究的任务书
一、研究背景和意义
水稻稻瘟病是世界范围内重要的稻米病害之一，其病原体为一种可通过昆虫传播的病毒。据统计，每年因稻瘟病造成的稻米产量损失高达20%以上，因此对稻瘟病的研究具有重要的意义。
近年来，随着生物学技术的进步，微RNA(miRNA)作为非编码RNA的一种，在各种生物学过程中起着重要的调控作用。研究表明，在某些植物病害发生时，miRNA表达水平会受到影响。然而，对于水稻SRBSDV(Southernriceblack-streakeddwarfvirus)病毒侵染后miRNA的表达变化尚未深入研究。
因此，本研究旨在通过深入分析SRBSDV对水稻miRNA表达的影响，探究其对水稻的影响机制，从而为水稻SRBSDV的防治提供有力的理论基础。
二、研究内容和方法
（一）研究内容
本研究将通过miRNA高通量测序技术，比较分析SRBSDV感染水稻前后miRNA的精细调控机制。具体包括以下内容：
1.SRBSDV感染前后水稻miRNA的检测和分析。
2.分析SRBSDV感染后水稻miRNA的差异表达，筛选出显著变化的miRNA，挖掘出与SRBSDV感染相关的miRNA。
3.对筛选出的miRNA进行靶向基因预测和功能注释，进一步探究SRBSDV感染后miRNA的调节作用。
4.建立SRBSDV感染后水稻miRNA与靶基因之间的调控网络图，揭示miRNA和靶基因之间的复杂相互作用关系。
（二）研究方法
1.样本采集和RNA提取：采用SRBSDV感染和未感染的水稻植株作为研究对象，对其进行总RNA提取，并经过RNA质量检测和纯化处理。
2.miRNA高通量测序：采用IlluminaHiSeq平台进行高通量miRNA测序，将所测序的miRNA得到的序列比对到水稻miRNA数据库中，筛选出显著变化的miRNA。
3.靶向基因预测和功能注释：采用miRanda、PicTar、TargetScan等软件对筛选出的miRNA进行靶向基因的预测，并对其功能进行注释和分类，以分析其调节作用。
4.miRNA与靶基因关系网络构建：通过miRNA和靶基因之间的相互作用关系，构建SRBSDV感染后水稻miRNA与靶基因之间的关系网络。
三、预期结果和意义
（一）预期结果
通过本研究，预期可以获得以下主要研究结果：
1.深入了解SRBSDV感染后水稻miRNA表达的变化特征。
2.发现SRBSDV感染后与水稻miRNA差异表达相关的miRNA类别和数量，为深入了解SRBSDV的致病机制以及水稻SRBSDV的整体调控提供理论支持。
3.预测SRBSDV感染后miRNA对水稻的靶向基因和调节作用，并对其进行功能注释和分类，以探究SRBSDV与水稻之间的相互作用关系。
4.建立SRBSDV感染后水稻miRNA与靶基因之间的关系网络，揭示miRNA与靶基因之间的调控关系及相关的生物学分子机制。
（二）意义
通过本研究，可以深入了解SRBSDV感染水稻后miRNA的表达和调控机制，为进一步探究SRBSDV的致病机制，寻找抗病机理等方面提供理论基础；同时可以为开发新型水稻抗性育种提供参考依据，并为探究其他作物病害的调控机理提供一定的参考模型。