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普通油茶转录组测序及其油脂代谢基因挖掘的中期报告
一、研究背景
普通油茶是重要的油料和营养植物资源，其种子中含有高达50%的油脂。油茶属于山茶科常绿乔木，生长在我国华南、华东、华中等地区。油茶的肉质种皮中含有大量内果皮，又称油皮，是油茶种子中油脂最多的部位。油皮所含的油脂是高营养价值的食用和工业用油，具有广泛的用途。
近年来，随着油茶生产的稳步发展，油茶颗粒的生产和应用变得越来越重要。因此，深入研究油茶油脂代谢过程及其调控机制，对于油茶的生产和利用具有重要的意义。
二、研究目的
本研究采用转录组测序技术，对油茶种子进行基因测序，分析相关基因的表达量和调控机制。主要目的是挖掘影响油茶油脂代谢的关键基因，为油茶油脂代谢机制的深入研究提供理论基础和实验数据。
三、实验方法
1）样品制备
从油茶种植园收集普通油茶种子，去除外果皮和内果皮进行挑选，筛选出较为一致的油皮。将不同生长时期（花蕾期、开花期和果实成熟期）的油茶油皮分别作为样品，制备RNA并进行转录组测序。
2）转录组测序
将RNA提取后进行cDNA合成，得到cDNA文库，利用IlluminaHiSeqXTen平台进行转录组测序，得到大量的序列数据。
3）数据处理和分析
利用Trimmomatic和SOAPdenovo-Trans软件进行数据处理和拼接，对比分析不同时期的基因表达谱，筛选代表油皮油脂代谢基因的候选基因，结合生物信息学分析和实验验证进一步确认油脂代谢关键基因。
四、预期结果
通过转录组测序和生物信息学分析，本研究将深度挖掘影响普通油茶油脂代谢的基因、途径和调控机制，并建立油茶油脂代谢关键基因的表达谱，深入阐明普通油茶油脂代谢机制的基础理论研究，为产业发展提供科学依据。