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DNA损伤修复相关基因多态性与肺癌易感性和放射敏感性关系的研究的任务书
任务书
题目：DNA损伤修复相关基因多态性与肺癌易感性和放射敏感性关系的研究
背景：
肺癌是当前全球范围内
流行性最高的癌症之一
，其中大约80-85%的患者是由吸烟引起的。然而，仅仅吸烟这一个因素不能完全解释为什么某些吸烟者会患上肺癌，而有些人却能长寿。同时，肺癌患者的DNA损伤修复机制也会受到损伤而失去功能，从而为肺癌的发生和发展提供了充足的可能。因此，探究DNA损伤修复相关基因多态性与肺癌易感性和放射敏感性关系成为当前的研究热点之一。
研究的意义：
本研究将有助于对肺癌发病的机制有更深入的认识，为早期诊断和精准治疗提供更加全面和准确的依据。同时，还将为精准预防肺癌提供关键性参考。
研究内容：
1.某些DNA损伤修复相关基因的多态性与肺癌发病风险的潜在关联。通过对肺癌患者及其亲属等控制组别的个体进行大样本基因测序，并根据各种可能的遗传模型进行统计分析，获得相关遗传模型的相对风险和可信区间等关键性参数。
2.某些DNA损伤修复相关基因的多态性与放射敏感性的关联。结合大量实验室条件，研究DNA修复遗传变异和放射敏感性的相关性，得出过度曝露于不同剂量的放射线情形下不同基因型个体的生存曲线，并从中获取有效信息和结论。
研究方法和技术路线：
1.样本采集和基因测序：收集2000例肺癌患者及其亲属的基本情况数据，获取其血液样本以进行基因测序。基因测序采用IlluminaHISEQ2000，得出个体基因组的SNP和INDEL信息等。
2.数据预处理和统计分析：对基因测序结果进行质控，得出符合标准的数据，进行相关的基因型分析、单基因遗传模型的拟合和分析，进而揭示基因型与风险的关系和相关的可信区间。
3.现场辐照实验：在容器中使用符合安全标准的放射线仪器，设定不同的辐射时间和剂量，将肺癌细胞（A549细胞系）与对照细胞线暴露于不同的辐射剂量下，进行细胞存活曲线的绘制，根据不同基因型的细胞存活率差异，研究DNA修复遗传变异和过度放射曝露的相关性和规律。
预期结果：
通过基因测序和实验室条件，获得大量数据并统计分析，揭示DNA损伤修复相关基因多态性与肺癌易感性和放射敏感性的关系，获取肺癌治疗和预防的新思路和新方向。
研究计划：
本研究计划总计为12个月，具体实施时间为2021年6月至2022年6月。
1）阶段一（前3个月）：
获取研究所需的肺癌患者及其亲属等人群基本情况，并获取其血液样本。同时，进行实验室内环境准备与规划，确定放射仪的型号、规格等，制定与放射实验相关的安全操作规程。
2）阶段二（中间6个月）：
对血液样本进行基因测序，对测序结果进行数据预处理和初步分析，筛选出满足质控要求的数据，进行基因型分析、遗传模型拟合和统计分析等，获得不同遗传模型个体与肺癌易感性和放射敏感性的相关性。
3）阶段三（后3个月）：
根据统计分析的结果，结合实验室环境条件和安全规程，进行细胞实验，研究DNA修复遗传变异和过度放射曝露的相关性和规律。
4）阶段四（最后一个月）：
对所有实验数据进行统计分析，得出相对风险和可信区间等关键性参数，整理得出研究结果与总结。同时撰写研究论文，开展相关学术交流会议与报告。
经费预算：
此项研究计划总预算为50万元，其中：
1.样本采集和基因测序费用为25万元；
2.样本分析和实验室费用为15万元；
3.数据分析和实验验证费用为8万元；
4.学术交流与报告费用为2万元。
参考文献：
1.D’AmicoTA.Molecularbiologicstagingofnon-smallcelllungcancer.AnnThoracSurg,1998,66(4):998-1006.
2.KoshiolJ,RotunnoM,ConsonniD,etal.Chronicobstructivepulmonarydiseaseandalteredriskoflungcancerinapopulation-basedcase-controlstudy.PLoSOne,2009,4(10):e7380.
3.ColesDR,SharpeRE,ClarkHW,etal.LungcancermortalityriskamongworkerswithsuspectedpreviousradonexposureinaBritishtinmine.IntJEpidemiol,1999,28(3):509-514.
4.PinnixZK,ChenJ,DrouetA,etal.Predictorsofradiation-inducedesophagealtoxicityinpatientswithnon-small-celllungcancertreatedwiththree-dimensi