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YAP的转录调控子GABP与肝癌的相关性研究的任务书
任务书
课题名称：YAP的转录调控子GABP与肝癌的相关性研究
研究背景：
肝癌是全球第五大恶性肿瘤，也是我国常见的致死性恶性肿瘤之一。肝癌的发病率逐年上升，治疗难度较大。因此，通过研究肝癌的分子机制，发现新的治疗靶点以及开发新的治疗方法和药物，对于提高治疗效果和预后具有重要意义。
YAP（Yes-associatedprotein）是一种核内的转录因子，能够通过与TEAD（TEA/ATTSdomain）转录因子结合，调节基因的表达。众所周知，YAP在多种人类肿瘤的发生和发展中起到了重要作用。近年来，研究人员发现，YAP激活了GABP（GA-bindingprotein）转录因子，促进了肿瘤细胞的增殖和侵袭。然而，GABP在肝癌中的作用和调控机制仍不清楚。因此，我们针对GABP在肝癌中的功能和转录调控机制进行研究，有助于深入了解肝癌的发生和发展过程。
研究目的：
本研究旨在探讨YAP调控GABP在肝癌中的作用和机制。具体包括以下几个方面：
1.研究YAP调控GABP促进肝癌细胞增殖和侵袭的分子机制。
2.探究GABP在肝癌中调控基因表达的机制，并筛选GABP的下游基因。
3.分析GABP在肝癌临床样本中的表达情况，分析GABP与肝癌患者的临床特征的关系。
4.探讨针对GABP的治疗策略，评价抑制GABP对肝癌治疗的潜在作用和安全性。
研究内容和方法：
1.分析GABP在肝癌中的表达情况：从NCBI平台下载肝癌和正常肝组织的转录芯片数据，并通过R语言和Bioconductor的Limma包进行基因差异表达分析，分析GABP在肝癌中的表达情况。使用Real-timeqPCR验证确立的差异表达基因，进行数据规范化处理并进行以细胞增殖、凋亡、侵袭为主的功能分析。
2.探究GABP在肝癌中调控基因表达的机制，筛选GABP的下游基因：通过交互分析预测获得GABP潜在下游进行筛选，进一步使用tpbl标记DAP-seq的数据验证筛选结果。
3.研究YAP调控GABP促进肝癌细胞增殖和侵袭的分子机制：使用siRNA和Cas9技术靶向控制YAP和GABP的表达，提取蛋白并进行免疫共沉淀分析来探究YAP调控GABP促进肝癌细胞增殖和侵袭的分子机制。
4.GABP在肝癌临床样本的表达情况及与患者临床特征的关系：采用免疫组化等技术对肝癌患者的组织标本进行检测，分析GABP在肝癌患者中的表达情况及其与患者临床特征的相关性。
5.探讨针对GABP的治疗策略，评价抑制GABP对肝癌治疗的潜在作用和安全性：利用CRISPR/Cas9技术构建GABP敲除细胞系进行体外试验，以及进一步用体内实验予以验证。最后，评价抑制GABP对肝癌治疗的潜在作用和安全性。
预期成果：
1.研究将深入探讨YAP调控GABP在肝癌中的作用和机制，为深入研究肝癌的治疗靶点和开发新药物提供新思路。
2.通过分析GABP在肝癌中的表达情况和筛选其下游基因，为肝癌的早期诊断和治疗提供重要参考。
3.通过分析GABP在肝癌患者中的表达情况及其与临床特征的相关性，为肝癌患者的诊疗提供更为准确的策略。
4.通过探讨针对GABP的治疗策略，评价抑制GABP对肝癌治疗的潜在作用和安全性，为肝癌治疗的转化医学研究提供更有前景的方向。
研究周期：36个月
经费预算：200万元
主要人员：
负责人：XXX
主要研究人员：XXX、XXX、XXX、XXX
参考文献：
1.ArnoldJ,etal.GABPasamasterregulatorofgeneexpression:newinsightsintothespecificityoftranscriptionfactorandDNAinteractions[J].CellularandMolecularLifeSciences,2019,76(9):1709-1722.
2.KimuraS,etal.ThetranscriptionfactorGABPselectivelybindsandactivatesthemutantTERTpromoterincancer[J].Science,2014,348(6238):1036-1039.
3.LiuY,WeiL.Geneexpressionprogramsinhepatocellularcarcinoma:biologicalandclinicalimplications[J].CurrentGenomics,2010,11(3):201-213.
4.WangR,etal.GABPoverexpression-guidedclassificationofhepatocellularcarcinomaandindicationforitstargetedth