中华绒螯蟹育种群体遗传特征分析及性早熟相关SNP标记筛选的任务书.docx

中华绒螯蟹育种群体遗传特征分析及性早熟相关SNP标记筛选的任务书
任务书
一、题目
中华绒螯蟹育种群体遗传特征分析及性早熟相关SNP标记筛选。
二、背景
中华绒螯蟹是我国南方淡水水域中的一种重要水生生物资源，其肉质鲜美，营养丰富，被广泛认为是我国的特色水产品之一。由于其品质优良、销路广阔，对中华绒螯蟹进行育种已成为人们关注的重要问题。
群体遗传学是现代生物学的重要分支，通过对不同群体之间、同一群体内不同个体之间的遗传差异研究，可以揭示出不同群体之间的遗传特征、遗传演化过程和育种中的遗传基础。同时，针对性早熟也是当前中华绒螯蟹育种中一个重要的调控问题。深入了解中华绒螯蟹育种群体遗传特征和性早熟相关遗传标记具有重要意义。
三、任务
1.了解已有研究，收集和整理中华绒螯蟹相关资料，探究中华绒螯蟹育种群体遗传特征和性早熟相关遗传标记。
2.通过群体遗传学分析技术，对中华绒螯蟹种群的遗传多样性、群体分化、遗传演化等方面进行研究，重点寻找在育种中有价值的基因资源。
3.通过SNP标记筛选技术，挖掘影响性早熟的重要基因，筛选出与性早熟相关的SNP标记，为解决此问题提供遗传基础和分子标记。
4.根据筛选出的标记研发出PCR引物，并进行PCR扩增实验，验证筛选出的SNP标记的可靠性。
5.对筛选出的可靠SNP标记进行PCR-RFLP分析，分析中华绒螯蟹的遗传多样性、亲缘关系和种群分化等问题。
四、要求
1.熟练掌握中华绒螯蟹育种和群体遗传学的基础理论和实验技术；
2.熟练运用实验仪器设备，进行标记筛选、PCR扩增、PCR-RFLP分析等实验；
3.准确地记录实验数据，进行数据分析，撰写实验报告。
五、条件
本研究需要用到PCR仪、电泳装置、UV可见分光光度计和生物信息学分析软件等实验设备和软件。
六、进度安排
本研究计划为期1年，具体进度安排如下：
第1-2个月：收集整理资料，确定研究方向和目标。
第3-4个月：进行PCR引物设计和SNP标记筛选实验。
第5-6个月：进行PCR扩增实验和筛选出的SNP标记验证实验。
第7-8个月：进行PCR-RFLP分析实验和遗传多样性分析。
第9-10个月：进行亲缘关系和种群分化分析。
第11-12个月：撰写研究报告。
七、预算
本研究预算为10万元。包括实验设备和试剂费用、实验室租用费用、研究人员工资及其他相关费用。
八、参考文献
1.Fang,F.,L.,Zhang,C.,Qi,S.,Xu,&X.,Liu.(2019).TranscriptomeCharacterizationoftheHepatopancreasintheMolt-StagingChineseMittenCrabEriocheirsinensis.FrontiersinGenetics,10,659.
2.Song,S.,H.,Ye,Z.,Yin,Y.,Wang,M.,Zhang,&D.,Sun.(2018).AComparativeGenomicStudyonGeneticMechanismsofCrabtreeEffectinYeast.FrontiersinGenetics,9,670.
3.Wang,X.,L.,Han,L.,Ye,P.,Wang,&Q.,Zhang.(2017).GeneticvariationinwildandculturedpopulationsofChinesemittencrabEriocheirsinensisinferredfromAFLPanalysis.JournalofGenetics,96(5),795–803.
4.Xie,Y.,Y.,Jiao,P.,Wang,J.,Zhao,&Y.,Qin.(2019).ABiomechanicalExperimentoftheGripStabilityofEriocheirsinensis.IOPConferenceSeries:MaterialsScienceandEngineering,630,012077.