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实时荧光定量PCR的基本原理在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PCR反应的进行,PCR反应产物不断累计,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图.荧光背景信号阶段:为扩增最初的10~15个循环,扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖,我们无法判断产物量的变化。 平台期:扩增产物已不再呈指数级的增加。PCR的终产物量与起始模板量之间没有线性关系,所以根据最终的PCR产物量不能计算出起始DNA拷贝数。荧光阈值:是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值,它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上,但一般我们将荧光域值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。 CT值:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称为CT值。CT值与起始模板的关系研究表明,每个模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,到达荧光阈值的CT值越小,反之越大。定量方法其他定量方法荧光定量PCR检测模式检测模式 在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。 SYBRGreenI工作原理水解探针模式(Taqman)一分子的产物生成就伴随着一分子荧光信号的产生,随着循环数增加,荧光信号不断积累。分子信标探针模式模板不存在时形成茎环结构,荧光基团和淬灭基团紧紧靠近而被淬灭。当存在模板时,环序列将与模板配对,此时分子信标成链状而非茎环状,荧光基团与淬灭剂分开,使得荧光基团发出荧光。引物设计原则Taqman探针设计原则实时荧光定量PCR的应用2.基因表达差异分析:例如比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异(如药物处理、物理处理、化学处理等),特定基因在不同时相的表达差异以及cDNA芯片或差显结果的确证. 3.基因分型:例如SNP检测,甲基化检测等。感谢您的观看!内容总结