拮抗酵母诱导番茄果实抗性基因的分离与功能鉴定的任务书.docx

拮抗酵母诱导番茄果实抗性基因的分离与功能鉴定的任务书
任务书
一、任务目的
1.了解番茄果实抗性机制及参与该过程的基因。
2.分离出番茄果实中拮抗酵母诱导的抗性基因。
3.对分离的基因进行功能鉴定以了解其在番茄果实抗性中的作用。
二、任务内容
1.对拮抗酵母诱导的番茄果实样品进行总RNA提取以及转录组测序。
2.借助生物信息学手段对测序结果进行初步处理、分析、筛选，得到参与番茄果实抗性的相关基因。
3.在初步筛选后，设计引物构建RT-qPCR实验，以便检测到感兴趣的基因表达的差异性。
4.构建特异的抗性基因的CRISPR/Cas9基因编辑系统并进行转化，以分析基因缺失或突变对番茄果实抗性的影响。
三、任务计划
1.第一周：提取总RNA并进行转录组测序。
2.第二周：处理、分析和筛选得到相关基因，设计引物进行实时PCR。
3.第三周：克隆、构建CRISPR/Cas9基因编辑系统，并对番茄进行转化。
4.第四周：进行转化后番茄植株的检测以及基因编辑后的功能分析。
5.第五周：总结分析实验结果，撰写实验报告。
四、实验条件
1.实验室要求：具备基本的分子生物学实验条件、设备、试剂和仪器等。
2.实验材料：由课题组提供的番茄和拮抗酵母等等。
五、安全注意事项
1.所有实验操作必须遵守实验室安全规范。
2.实验室必须具备合适的安全设施和管理。
3.实验中要注意个人卫生防护措施。
六、经费预算
本实验的经费包括实验材料费、试剂费、设备费、实验室卫生费、管理费、实验操作者劳务费等，总预算为人民币￥30,000元。
七、任务要求
1.实验操作严格按照任务计划且完成实验原始记录。
2.根据实验结果撰写实验报告，实验报告要求包括研究背景、实验目的、实验原理、结果及分析和结论等，同时采用学术规范编写。
3.及时交付实验报告。
八、任务评估
1.实验数据：完整、准确、详实。
2.报告质量：文献资料收集充分、符合学术表达规范、分析结果合理。
3.实验方法和步骤：操作规范、安全使用仪器。
九、任务进度安排
1.第一周：组织实验，提取样品进行转录组测序。
2.第二周：开始对转录组测序结果进行初步筛选和分析，并设计RT-qPCR。
3.第三周：构建CRISPR/Cas9基因编辑系统，并进行转化。
4.第四周：对转化后的番茄植株进行检测，执行基因编辑后的功能分析。
5.第五周：完成实验报告撰写并进行总结。
十、参考文献
1.BarmanSR,etal.(2018)Genome-wideidentificationandanalysisofStSZIPgenefamilyintobacco(NicotianatabacumL.)anditsresponsetoabioticstresses.BMCGenomics,19(1):997.
2.GayosoCastroLA,etal.(2019)WhiteflyresistanceintomatohybridsinvolvingtheTy-1geneunderintegratedpestmanagement.SciRep,9(1):13315.
3.LiH,etal.(2018)AWRKYtranscriptionfactornegativelyregulatestheOsROS1geneandtherebyoxidativestressresponsesandphotosynthesisinrice.PlantPhysiol,178(1):381-394.