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番茄BAC克隆的paralogous同源克隆的筛选的综述报告 BAC(Bacterialartificialchromosome)克隆技术是基于大肠杆菌(Escherichiacoli)的人工染色体构建技术,可用于在真核生物基因组中进行高效的克隆扩增。在植物基因组的研究中,利用BAC克隆技术可以扩增大量的基因和DNA片段,特别是在番茄基因组的研究中有着广泛的应用。 基因家族是基因组中非常重要的一部分,它们在生物进化过程中起着关键的作用。从基因组的角度来看,基因家族的特征之一是它们往往存在于基因组中的多个位置,并且在结构和功能上相似。这些基因被称为同源基因或家族成员。在番茄基因组中,有一些基因家族已经被鉴定出来,例如,番茄细胞壁蛋白家族、GST基因家族、NBS-LRR抗病基因家族等。 同源基因家族成员的克隆筛选通常依赖于同源序列探针的使用和相关的DNA序列数据库。从番茄基因组中,同源基因家族的克隆可以从BAC文库中通过杂交筛选和PCR扩增得到。 为了克隆同源基因家族的成员,需要针对性地设计合适的探针。通常的方法是通过与已知基因家族成员的序列比对和分析,确定家族共有的保守区域和可变区域,然后基于这些区域设计高度保守的探针。 同时,在设计探针的过程中,需要考虑一些因素,例如选择合适的引物和探针长度、避免序列的交叉杂交和设计与最近共同祖先保守的区域等。利用这些探针对BAC文库进行筛选,可以高效地获得同源基因家族的克隆。 在番茄基因组中,通过BAC克隆技术获得链霉素耐受基因家族(Lst1)的克隆便是一个成功的案例。通过使用多探针杂交筛选,研究者成功克隆了Lst1家族的多个成员,并对其进行了系统的分析。 除此之外,还有一些其他的方法可以结合BAC克隆技术用于同源基因家族成员的克隆筛选,例如基于PCR扩增和南方杂交等方法,这些方法的使用也取决于研究目的和样品适用性。 在总体上,BAC克隆技术可以为同源基因家族的克隆筛选提供高效、准确和可靠的手段,并且具有广泛的适用性和实用性,是植物基因组学研究中不可或缺的技术手段之一。