海带“单倍体十号”cDNA文库构建及EST序列分析的综述报告.docx

海带“单倍体十号”cDNA文库构建及EST序列分析的综述报告
海带“单倍体十号”cDNA文库构建及EST序列分析的综述报告
摘要：本文综述了海带“单倍体十号”cDNA文库构建及EST序列分析的研究进展。海带是一种重要的海洋经济植物，其具有特殊的抗氧化性、抗菌性、降血压、降胆固醇、降血糖等生物活性，因此被广泛应用于食品、药品、化妆品等领域。建立海带cDNA文库并分析其EST序列是开展海带基因功能和代谢途径的研究的必要前提。
关键词：海带；cDNA文库；EST序列；基因功能
1.简介
海带（Undariapinnatifida）是一种常见的海洋红藻，属于垂枝红藻科。它们生长在亚寒带和温带的岩质和硬质物体上，是一种高产量、高营养价值的海藻。海带富含蛋白质、矿物质、多糖、褐藻胶等多种生物活性物质，具有抗氧化性、抗菌性、降血压、降胆固醇、降血糖等多种生物活性。
2.海带cDNA文库构建
为了探索海带的基因功能和代谢途径，建立海带cDNA文库是必要的前提。海带cDNA文库构建的基本步骤如下：
（1）RNA提取：使用TriZol试剂提取海带组织总RNA。
（2）cDNA合成：采用SMART技术合成第一链cDNA，接着用高保真DNA聚合酶进行二链合成，得到cDNA。
（3）文库构建：将cDNA片段连接到载体上，转化至大肠杆菌，获得cDNA文库。
3.海带EST序列分析
EST（ExpressedSequenceTag）是从已知基因中克隆和测序的短序列。通过对EST序列的分析，可以探究物种基因表达及其代谢途径。针对海带EST序列的分析主要包括以下几个方面：
（1）基因表达分析：利用EST序列，可以研究不同生长条件下海带基因表达的差异。比较基因表达水平，寻找表达量变化的差异性基因。
（2）寻找基因启动子：基于EST序列进行生物信息学分析，可以鉴定出编码区域与非编码区域，从而寻找出一些潜在的基因启动子元件。
（3）寻找新基因：EST序列也可以用来发现新基因和新转录本。通过比较EST序列与数据库中的基因序列，可以鉴定出新的基因和新的转录本。
（4）代谢途径分析：通过EST序列分析，可以确定代表某种代谢途径的基因集，为海带代谢途径的研究提供有力依据。
4.结论
海带cDNA文库的构建及其EST序列的分析，为海带基因功能和代谢途径的研究提供了重要的基础。未来的发展方向是开展海带基因组学研究，揭示其基因组结构、基因家族、基因组演化等方面的知识，为海带遗传改良和利用提供更加优良的品系和组织工程产物。
参考文献：
[1]张小涵,许义洲,张婷婷.武夷山海域海带(Undariapinnatifida)EST序列分析[J].海洋通报,2015,35(06):644-651+665.
[2]唐莉,王伟,周锋,等.水域养殖海带生长阶段cDNA文库构建及其EST分析[J].应用与环境生物学报,2009,15(2):207-212.
[3]HwangEK,ParkCS,LeeJM,etal.ConstructionofacDNAlibraryfromwakame(Undariapinnatifida)anditsapplicationforexpressedsequencetag(EST)analysis[J].CanadianJournalofFisheriesandAquaticSciences,2004,61(5):743-748.