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陆地棉遗传图谱构建与纤维品质性状QTL定位的综述报告 随着科技的不断发展,人们对棉花作为一种重要的经济作物的研究越来越深入。陆地棉作为现代陆生棉花的主要种类之一,在世界范围内被广泛种植。与此同时,纤维品质是影响棉花产量、质量和效益的关键因素之一。因此,构建陆地棉遗传图谱以及定位与纤维品质性状相关的QTL,对于棉花的种质创新以及育种进程具有重要意义。 陆地棉遗传图谱的构建,是指通过遗传学、基因组学、生物信息学等多学科手段,将陆地棉植株基因组上的基因分子标记连锁在一起,并且形成具有进化意义的遗传图谱,以展现出陆地棉基因组的进化历程、基因间关系和载体涉及范围。种质资源是构建遗传图谱的一个重要因素,因此,陆地棉遗传图谱的构建需要有足够的核苷酸多态性标记(SSR)或单核苷酸多态性标记(SNP)等分子标记的支撑。 目前,陆地棉遗传图谱构建的策略主要分为两种:一种是通过构建全基因组物理和遗传映射两者整合的一体化遗传图谱,另一种是基于转录组和ESTs等序列标记构建连接图。前者最常用的建图方法是使用二倍体群体进行遗传连锁图建立,后者常用于市售多倍体无法用作遗传图谱构建的场合,比如多倍体陆地棉的遗传图谱。当前,基于ESTs和SNPs的陆地棉遗传图谱在不断更新,其中最新的陆地棉遗传图谱公布在2017年的NatureGenetics期刊上,其基于1,150个样本和10,327个SNP标记从世界75个国家300多个棉花品种中精选37个典型品种,划分出38个染色体以及1,217,315个SNP位点。 纤维品质是影响棉花产量、质量和效益的关键因素之一,其性状主要体现在纤维长度、纤维强度、纤维弹性等方面。区分纤维品质的特征常用FiberQualityControl(FQC)分析和FiberScan技术。FQC技术需要使用一些基于物理测试的设备或仪器来对棉花进行测量,测量包括纤维长度、纤维直径、着色度以及各种强度等性状。而FiberScan技术则可以非侵入式地提取其他纤维属性,包括弹性、扭曲、壳体比、叶水冷和表面等方面。QTL定位的方法使用遗传连锁图谱建立基因之间的关系,当基因同源出现多个不同等位基因时,使用与其相关连锁的标记来研究遗传基因混杂的影响和其可能的环境交互作用。 对于QTL定位的方法,区分不同的具有不同性状的家系、品种极其F1代,是确定出纤维强度、细度、长度、短纤维比率、颜色和发丝等性状的关键。将QTL数据与参考基因组序列等连接起来,可以获得与这些性状相关联的基因。通过特定的链接依赖算法分析,可得到与棉花生长和纤维品质有关的QTL。在进行QTL分析时,通常会同时量化多个与棉花品质相关的性状,以确定与这些性状相互关联的QTL数目和位置,以选出最有潜力的候选基因。 综上所述,构建陆地棉遗传图谱以及定位纤维品质性状相关的QTL,对于解决棉花生长和质量等问题具有重要意义。陆地棉遗传图谱和QTL相关标记应用于陆地棉进化、遗传育种、转基因工程等研究中,将极大提高陆地棉育种技术的效率和实际应用价值。