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基于双聚类方法分析基因表达数据的研究的中期报告 一、研究背景和意义 随着高通量技术的广泛应用,基因表达数据的产生和积累越来越多。如何从海量的基因表达数据中挖掘有意义的信息,对于挖掘基因的功能、研究疾病发生机制等具有重要意义。而双聚类方法是一种重要的分析基因表达数据的方法,可以从两个维度同时对基因和样本进行聚类,挖掘出在特定条件下具有相关性的基因和样本,并发现表达模式的生物学意义。因此,本研究旨在运用双聚类方法分析基因表达数据,挖掘出表达模式和寻找到调控基因,为进一步深入研究基因功能和疾病机制奠定基础。 二、研究进展 1.收集和筛选样本数据 本研究采用多组基因表达数据进行分析,数据来源于公共数据库以及文献报道,经过筛选,筛选出符合本研究要求的基因表达数据共计XX组。 2.双聚类分析 本研究将采用基于位移的模型(BPM)算法,对每组基因表达数据进行双聚类分析。该算法不仅能够同时对基因和样本进行聚类,还可以发现弱双聚类。 3.结果分析 运用双聚类方法分析基因表达数据,可以发现具有相关性的基因和样本,进而发现表达模式的生物学意义。本研究将运用一系列统计学方法对结果进行分析和解释,并结合生物学知识和文献报道,寻找到调控基因,为进一步研究基因功能提供指导。 三、研究计划 1.继续收集和筛选样本数据,扩大基因表达数据的样本量。 2.运用BPM算法进行双聚类分析,挖掘出表达模式,并寻找调控基因。 3.对结果进行统计学分析和生物学解释。 4.结合文献报道,进一步探究基因功能和疾病机制。 四、研究成果和展望 本研究将通过双聚类方法分析基因表达数据,运用一系列统计学方法和生物学解释,挖掘出表达模式和寻找到调控基因,为进一步深入研究基因功能和疾病机制提供参考,并为生物信息学领域提供新的研究思路和方法。