玉米穗行数主效位点qKRN5.04的精细定位与候选基因挖掘的任务书.docx

玉米穗行数主效位点qKRN5.04的精细定位与候选基因挖掘的任务书
任务书
任务名称：玉米穗行数主效位点qKRN5.04的精细定位与候选基因挖掘
任务背景：
玉米是人类主要的粮食作物之一，穗行数是影响玉米产量的一个重要因素。研究表明，qKRN5.04是玉米穗行数的主要效应位点，该位点已经通过定位初步确定在玉米第5染色体上，但具体基因和作用机制尚未揭示。
任务目的：
本任务旨在对qKRN5.04位点进行精细定位，并挖掘其可能的候选基因，以期为进一步研究玉米穗行数的形成机制提供有力的依据。
任务内容：
1.玉米种质资源的收集：收集包括玉米穗行数不同的自然变异或人工杂交、诱变等方法获得的玉米种质资源，以增加研究样本的多样性。
2.扩增标记位点：根据qKRN5.04位点的位置信息和前期研究结果，设计适当的引物扩增标记位点，以进一步缩小定位的范围。
3.建立遗传图谱：根据扩增的标记位点，建立玉米第5染色体的遗传图谱，确定qKRN5.04位点在该染色体上的相对位置。
4.精细定位：通过对多个重复的穗行数表型进行测定，利用连锁群体分析和多点定位法，精细定位qKRN5.04位点。
5.候选基因挖掘：利用生物信息学技术，对qKRN5.04位点周围的基因进行全面筛查和分析，鉴定其可能的功能和作用机制，以寻找可能的候选基因。
6.确认候选基因：通过基因克隆、功能鉴定和转基因实验等手段，进一步验证候选基因与玉米穗行数的相关性，并进一步揭示其具体作用机制。
任务进度安排：
本任务计划历时2年，具体进度安排如下表所示：
|任务内容|起止时间|
|:----|:----:|
|玉米种质资源的收集|第1个月至第6个月|
|扩增标记位点|第7个月至第12个月|
|建立遗传图谱|第13个月至第18个月|
|精细定位|第19个月至第24个月|
|候选基因挖掘|第25个月至第30个月|
|确认候选基因|第31个月至第36个月|
任务成果：
1.精细定位qKRN5.04位点在玉米第5染色体上的具体位置。
2.鉴定并筛选出qKRN5.04位点周围的候选基因，并初步分析其可能的功能和作用机制。
3.进一步验证并确认候选基因与玉米穗行数的相关性，并初步揭示其作用机制。
4.生成一批新的玉米种质资源，以供下一步研究使用。
参考文献：
1.孙红怡,章永青,张旺才,刘才富.玉米穗行数的QTL定位及其应用.遗传,2005(3):pp.18-22.
2.孙红怡,陈玉石,张旺才,等.玉米穗行数QTL环境效应的分析.作物学报,2007(4):pp.479-485.
3.刘升泉,刘曙光,辛胜利,等.基于MAS的玉米高产关键基因标记与多效性分析.作物研究,2006(3):pp.334-338.