利用SSR技术构建甜瓜品种（系）核酸指纹图谱任务书.docx

利用SSR技术构建甜瓜品种（系）核酸指纹图谱任务书
一、任务描述
本任务旨在利用SSR技术构建甜瓜品种（系）核酸指纹图谱，从而为甜瓜的遗传育种、品种鉴定等方面提供技术支持和数据支持。本任务的实施内容包括甜瓜样本采集、DNA提取、SSR扩增、PCR产物分析和数据处理等环节。
二、任务流程
1.甜瓜样本采集
本任务需要采集多个甜瓜品种（系）的样本，确保样本种质丰富、覆盖范围广、数量充足，在采集时应按照以下步骤进行操作：
（1）在甜瓜成熟后采集果实，并在采集时记录下样本来源、品种名称、采集位置等信息；
（2）将采集的果实放入密闭袋中，尽量减少样品的氧化和交叉污染风险；
（3）将密闭袋放入密闭盒中，冷藏保存，并在24小时内送至实验室进行DNA提取。
2.DNA提取
DNA提取是构建核酸指纹图谱的关键步骤，本任务推荐采用CTAB法进行DNA提取，操作步骤如下：
（1）将甜瓜果实切碎至细碎状态，取约0.1g样品置于离心管中；
（2）加入适量的CTAB提取液进行组织细胞破裂；
（3）通过氯仿、异丙醇等溶剂的提纯、沉淀，分离出DNA沉淀物；
（4）使用TE缓冲液溶解DNA并测定DNA浓度和纯度。
3.SSR扩增
SSR扩增是核酸指纹图谱构建的核心步骤，本任务推荐选用已知高保真度、多态性好的甜瓜SSR引物，进行PCR扩增反应，操作步骤如下：
（1）将提取的DNA按照所需的浓度稀释至合适的浓度，加入反应管中；
（2）加入PCR反应缓冲液、引物、酶和样品，进行PCR反应；
（3）通过PCR反应结果判断引物扩增效果，挑选效果好的引物进行扩增。
4.PCR产物分析
SSR扩增反应所得产物需要经过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析，获取核酸指纹图谱。操作步骤如下：
（1）将PCR反应产物与DNA标准品一起进行电泳分离；
（2）将凝胶进行银染处理；
（3）通过凝胶条带大小、数量、强度等特征判断甜瓜样品的遗传多样性。
5.数据处理
最后，对分析结果进行数据处理和分析，构建甜瓜品种（系）的核酸指纹图谱，并利用多样性指数分析和群集分析等方法对甜瓜品种（系）间的关系进行研究。
三、任务意义
构建甜瓜品种（系）核酸指纹图谱的意义在于：
1.为甜瓜遗传育种提供基础数据和技术支持，促进甜瓜品种的改良和优化。
2.为甜瓜品种鉴定提供技术手段和依据，确保甜瓜产品质量和品种纯度。
3.探索甜瓜品种（系）间的遗传差异和关系，为甜瓜生物学研究提供支持。