苹果栽培品种SSR指纹图谱的构建.pdf

果树学报2012，29（6）:971～977
JournalofFruitScience

苹果栽培品种SSR指纹图谱的构建

王立新1，张小军1，史星雲1，高华1，2*，赵政阳1，2*

（1西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌712100；2陕西省苹果工程技术研究中心，陕西杨凌712100）

摘要：【目的】通过构建苹果栽培品种的SSR标记指纹图谱数据库，以实现对苹果品种的快速、准确鉴定。【方法】以
国内外40个主要栽培品种为试验材料，选用均匀分布于17条染色体上的144对SSR引物进行PCR扩增并采用
6％变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与SSR荧光标记毛细管电泳相结合的方法进行检测。【结果】结果表明，从144对SSR
引物中筛选出了35对多态性较高、谱带清晰的引物，35对引物共检测到314个等位基因，每对SSR引物扩增出等位
基因数3～15个，平均8.97个；多态性信息含量指数（PIC）变化为0.4553～0.8346，平均为0.6920；各个位点的杂合度
在0.4750～1.0000，平均为0.7943；标记系数（MI）平均为6.2080，其中CH04c10引物对苹果基因组DNA变异检测
最有效，其多态性信息含量指数和标记指数均最高，分别为0.8346和12.5190。以CH03d07、NZ02b1和CH05c04
这3对引物进行组合鉴定，即可将40个苹果品种完全区分开。与6％变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测方法相比，荧光
标记毛细管电泳检测能更准确读出目标片段的大小，检测效果更为理想，更适合于DNA指纹图谱数据库的建立。
【结论】将2种检测方法结合构建苹果品种DNA指纹图谱，结果更准确、更可靠。
关键词：苹果；SSR标记；荧光标记；指纹图谱
中图分类号：S661．1文献标志码：A文章编号：1009－9980(2012)06－971－07

EstablishmentofSSRfingerprintingdatabaseonmajorapple（Malus×
domestica）cultivars
WANGLi-xin1，ZHANGXiao-jun1，SHIXing-yun1，GAOHua1，2*，ZHAOZheng-yang1，2*
（1CollegeofHorticulture，NorthwestA&FUniversity，Yangling，Shaanxi712100China；2AppleE&TResearchCentreofShaanxiProvince，
Yangling，Shaanxi712100China）
Abstract:【Objective】InordertoidentifyapplecultivarSaccurately，weestablishedSSRfingerprinting
databaseonmajorapple（Malus×domesticaBorkh.）cultivars.【Method】Taking40majorcultivarSofdo-
mesticandoverseaSapplesasmaterials，144pairsofSSRprimerSwhichwerechosenfrom17chromo-
someswereusedtoproceedwithPCRamplificationandtheresultSwereidentifiedbythecombinedmeth-
odsof6%denaturingpolyacrylamidegelelectrophoresiSdetectionandcapillaryelectrophoresiSdetection
withfluorescentSSRmarkers.【Result】Resultsshowedthat35pairsofSSRprimerSwhichcouldamplify
stableanddistinctbandswerescreened.The35pairsofSSRprimerSamplifiedatotalof314alleles.Alle-
lesamplifiedbyeachpairofprimerSrangedfrom3to15，withameanof8.97.Thepolymorphicinforma-
tioncontentvalues(PIC)rangedfrom0.4553to0.8346，withameanof0.6920.Theheterozygosity
rangedfrom0.4750to1.0000，withameanof0.7943.Theaverageofmarkerindex(MI)was6.2080and
thelocusCH04c10waseffectivetodetectDNAvariat