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恶性肿瘤患者血浆KRAS基因突变检测的开题报告 开题报告 题目:恶性肿瘤患者血浆KRAS基因突变检测 一、研究背景及意义 恶性肿瘤是世界公认的一个重大健康问题,也是全球最大的死亡原因之一。早期诊断和治疗是控制恶性肿瘤死亡率的关键。目前,常规的肿瘤诊断依赖于组织病理学检测和影像学检查等技术。然而,这些方法依赖于组织样本,需要侵入性手段获取,不仅痛苦而且具有一定的风险。此外,像肺癌等肿瘤,由于不易从患者体内得到足够的组织样本,增强了早期诊断和治疗的困难。 近年来,许多研究表明,肿瘤细胞释放的DNAs(cfDNA)可以在血液中被检测到。血浆中的cfDNA可用于非侵入性诊断恶性肿瘤和监测肿瘤进展。然而,由于cfDNA含量低,并含有许多正常细胞的背景DNA,这使其分离,富化和检测变得困难。因此,开发高效、敏感的肿瘤标志物检测技术已经成为当前临床肿瘤诊断的热点领域。 KRAS基因突变是许多恶性肿瘤中经常出现的变异之一。目前,KRAS等基因突变已成为临床肿瘤治疗的重要标志物之一。因此,KRAS基因突变在非侵入性诊断及常规治疗方案的制定中具有重要的意义。 二、研究目的和内容 本研究旨在利用一种特定的PCR技术检测血浆中的KRAS基因突变。首先,我们将收集40名恶性肿瘤患者和40名正常人的血液样品。随后,我们将提取血浆中的cfDNA,以确保我们在分析样品时仅考虑肿瘤细胞来源的DNA。接着,我们将使用基于分子标记PCR的技术检测KRAS基因的突变。最后,我们将分析KRAS基因突变与恶性肿瘤之间的相关性,比较其与常规组织学诊断的可靠性。 三、研究方法 3.1受试对象 本研究将招募40名新诊断的恶性肿瘤患者和40名无恶性肿瘤的正常志愿者。 3.2样本收集和处理 所有受试者将进行血液采集,收集血清样本。我们将利用血清分离管分离血清,随后利用血细胞分离管分离白细胞。我们将使用琼脂糖凝胶电泳(agarosegelelectrophoresis)评估DNA质量及确保分离的cfDNA包含大小适中、未被降解的DNA碎片。 3.3DNA提取 我们计划使用血浆cfDNA提取试剂盒(Qiagen)提取血浆cfDNA。 3.4PCR扩增 我们将使用KRAS基因的启动子区域两端引物扩增KRAS基因的外显子2。扩增后,我们将使用琼脂糖凝胶电泳评估PCR产物。 3.5限制性内切酶切割及测序 我们将使用限制性内切酶切割(例如BstNI/EcoRI)识别KRAS基因外显子2的突变并进行测序。测序后,我们将使用软件进行突变检测。 四、预期结果 我们预计该研究将提供恶性肿瘤患者KRAS基因突变检测的一种非侵入性方法。我们依靠此检测方法,开发出一种可靠、敏感和准确的肿瘤标志物检测方法,在肿瘤诊断和治疗中具有广泛的应用前景。 五、研究进度 本研究计划从2021年10月开始,预计于2022年6月完成。具体进度如下: 阶段一:患者招募和样本收集(2021年10月-2021年12月)。 阶段二:样品预处理、DNA提取及KRAS基因PCR扩增(2022年1月-2022年3月)。 阶段三:测序、分析数据和结果整理(2022年4月至2022年6月)。 六、参考文献 1.Bronkhorst,A.J.,Aucamp,J.,Pretorius,P.J.,&Cornelius,C.(2019).Cell-freeDNA:preanalyticalvariables.ClinChimActa,500,190–199.(doi:10.1016/j.cca.2019.09.019) 2.He,C.,&Gao,P.(2019).NoninvasiveDetectionofSomaticMutationsforCancerDiagnosis:AnUpdate.ClinChem,65(8),986–1003.(doi:10.1373/clinchem.2018.301401) 3.Lee,Y.,Liu,L.,&Wang,J.(2018).SystemicEvaluationofBloodPlasmaSamplePreparationforQuantitativeProteomicsStudiesUsingShotgunProteomics.JProteomeRes,17(4),1830–1840.(doi:10.1021/acs.jproteome.8b00145) 4.Nong,J.,Gong,Y.,Gu,J.,&Han,Y.(2019).AComprehensiveReviewofCirculatingTumorDNADetectionTechnologiesandTheirClinicalApplications.JMolDiagn,21(3),371–383.(doi:10.1016/j.jmoldx.201