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利用SNP标记构建油菜品种指纹图谱及定位下卷叶性状基因的研究的开题报告 一、选题背景 油菜(BrassicanapusL.)是我国重要的油料作物之一,种质资源丰富,但是其中存在一系列复杂的遗传性状,如下卷叶性状,严重影响着油菜的高效育种。为了解决这一问题,基因定位和分子标记辅助选择育种具有重大意义。 利用分子标记技术构建油菜品种指纹图谱及定位下卷叶性状基因,可以为油菜的遗传改良和种质资源的利用提供有力的支持。 二、研究内容 本研究将采用SNP标记技术,以含有下卷叶性状和正常叶形的油菜品种群为研究对象,利用Illumina高通量测序技术获取SNP标记信息,并构建油菜品种指纹图谱。随后,采用QTL分析法,对下卷叶性状的基因进行定位和检验。最后,利用基因克隆等技术深入研究下卷叶性状形成的分子机制和调控网络。 三、研究意义 本研究的主要意义在于: 1.为油菜遗传改良和育种提供了有效的分子工具,为油菜高产、优质、抗逆和种植适应性等方向的育种研究提供了支持。 2.为探索下卷叶性状形成的分子机制和调控网络提供了研究基础。 3.探索SNP分子标记技术在油菜遗传研究中的应用价值。 四、研究方法 1.实验材料:含有下卷叶性状和正常叶形的油菜品种群。 2.SNP标记信息获取: (1)提取全基因组DNA,构建文库,采用Illumina高通量测序技术获得高质量SNP标记。 (2)利用生物信息学平台对测序数据进行分析,挑选出高质量的SNP标记信息。 (3)筛选优秀的SNP标记,构建油菜品种指纹图谱。 3.下卷叶性状基因的定位: (1)采用QTL分析法对下卷叶性状基因进行定位和检验。 (2)对定位到的QTL区间进行基因克隆和功能鉴定。 五、进度安排 第一年: 1.文献调研与综述撰写2个月; 2.SNP标记信息获取与筛选4个月; 3.油菜品种指纹图谱构建2个月。 第二年: 1.下卷叶性状基因定位和验证6个月; 2.下卷叶性状形成机制和调控网络研究2个月。 第三年: 1.基因克隆和功能鉴定6个月; 2.结果分析与论文撰写2个月。 六、经费预算 本项目预计需要的经费约为30万元,主要包括材料费、设备购置、人员费用等。 七、预期成果 1.获取含有下卷叶性状和正常叶形的油菜品种群SNP标记信息。 2.构建油菜品种指纹图谱。 3.对下卷叶性状基因进行定位和检验,并分析下卷叶性状形成的分子机制和调控网络。 4.发表高水平学术论文2-3篇。