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河北农业科学2007,11(4):73-75 JournalofHebeiAgriculturalSciences 分子标记在作物育种中的应用 于德花 (东营市农业科学研究所,山东东营257091) 摘要:综述了几种DNA分子标记技术的原理、特点及其在作物遗传育种研究中的应用,并对其 进行了展望。 关键词:分子标记;遗传育种;应用 中图分类号:S336文献标识码:A文章编号:100821631(2007)0420073203 MolecularMarkersandUtilityinCropBreeding YUDe2hua (DongyingInstituteofAgricultureSciences,Dongying257091,China) Abstract:Thedevelopmentofmolecularmarkersandtheirutilityinplantbreedingwerereported,someprospec2 tivewerealsosuggested1 Keywords:Molecularmarcers;Heredityandbreeding;Application 性纯合和杂合基因型,提供的信息量不完整。 1分子标记 RAPD引物已经商品化,不需要自己合成。商品化 分子标记是以DNA分子碱基序列的变异作基的RAPD引物基本能覆盖整个基因组,检测的多态 础,所揭示的多态性直接反映基因组DNA间的差性远远高于RFLP[6]。由于使用了较短的引物, 异。与形态学标记、细胞学标记和生化标记比较,RAPD标记的PCR易受实验条件的影响,其检测 分子标记具有准确度高、数量多、多态性高、共显结果的重复性较差,因此在一定程度上限制了它的 性好、对表型无影响、检测手段简单快捷以及开发应用。AFLP标记是由Zabean和Vos(1993年)发 ~ 和使用成本低[14]等优越性。明的一项DNA分子标记,具有RFLP和RAPD的 几种常用的分子标记有RFLP标记、RAPD标优点,能提供比RFLP和RAPD标记更多的基因组 记、AFLP标记、SSR标记、ISSR标记和SNP标多态性信息,被认为是目前最有效的分子标记,具 记。其中,RFLP标记是出现最早、应用最广泛的有检测位点多,操作简便,速度快,DNA用量少, DNA标记技术之一,其结果稳定可靠、重复性好,遗传标记具有共显性和显隐性,多态性高等优点。 是一种共显性标记,但由于该技术需要DNA的量该技术的缺点是需用同位素,危害人的健康,成本 大,需要仪器设备多和技术较复杂,而且检测中一较高。SSR标记最大优点是具有大量的等位差异, 般要用放射性同位素,不太安全,因而影响了其在多态性十分丰富,还具有操作简单、快速、稳定性 育种上的使用和推广。RAPD标记是一种遗传标好、成本低等特点,但是SSR标记必须依赖测序 记[5],具有对DNA需要量少和质量要求不高,操设计引物,引物的开发比较困难,不像RAPD引物 作简单易行,不需要接触放射性物质,一套引物可可随机合成,所以开发成本较高。ISSR标记是近 用于不同生物的基因组分析,可检测整个基因组等年发展起来的一类新型的分子标记技术,是Zietk2 优点,是继RFLP之后应用最广泛的分子标记,特iewicz等人于1994年创建的一种简单序列重复区 别是在寻找与目的基因连锁的分子标记方面,近年间扩增多态性分子标记,其结合了RAPD和SSR 来报导了大量的与各种目的基因连锁的RAPD标的优点,通常为显性标记,呈孟德尔式遗传,具有 记。由于RAPD标记是一种显性标记,不能区分显很好的稳定性和多态性。SNP标记是最近发展起来 收稿日期:2007206223 作者简介:于德花(1967-),女,山东东营人,副研究员,从事作物育种及逆境栽培研究。 47河北农业科学第11卷 的单核苷酸多态性(SNP)标记。这种类型的应,进而对其定位。AFLP是目前为止作图效率最 DNA多态性仅有2个等位基因的差异,所以SNP高的一种标记。 最大的杂合度为50%。尽管单一的SNP所提供的213重要性状的基因定位 信息量远小于现在常用的遗传标记,但是SNP数基因定位就是把一基因定位到染色体的具体位 量丰富,可以进行自动化检测,因此SNP具有广置上。根据样品的来源,常用的基因定位方法有近 泛的应用前景。等基因系法和分离群体分群分析法2种。分子标记 分析在各种作物的质量性状甚至是数量性状基因的 定位研究中获得广泛应用。Meksem等[14]利用F 2分子标记在作物遗传育种研究中的应用1 群体,找到与马铃薯抗晚疫病紧密连锁的AFLP标 211亲缘关系和遗传多样性的研究记,该标记位于5号染色体上。BendahmaneA 分子标记既能检测种内的遗传多样性,也可