甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究的开题报告.docx

甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究的开题报告
开题报告：
甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究
一、研究背景
猪是我国的主要畜禽之一，其产品如肉、皮、毛等对国内贸易和对外出口都有着极大的贡献。然而，由于繁殖的方式不同，不同地域和品种之间的基因遗传差异较大，致使其生长速度、肉质品质、疫病抵抗力等方面表现不一致，对我国猪的品种改良和保护都带来一定的挑战。因此，对我国不同地域和品种之间的遗传多样性进行系统和全面的研究具有重要意义。
二、研究目的
本研究旨在通过微卫星DNA分析方法探究甘肃地区常见猪种（如甘肃白猪、三阳猪等）的遗传多样性特征，为猪的品种改良、资源保护和开发提供相关基础数据。
三、研究内容和方法
3.1研究内容
（1）采集样本，对甘肃地区的常见猪种进行样本采集；
（2）提取DNA，利用琼脂糖凝胶电泳和分子生物学技术进行DNA的提取和纯化；
（3）筛选微卫星标记，根据已知的猪微卫星标记序列资料进行选择，筛选出适用于甘肃地区猪的微卫星标记；
（4）PCR扩增，利用PCR扩增引物对筛选出的微卫星标记进行扩增；
（5）电泳检测，利用电泳技术检测PCR扩增产物，获取与微卫星长度序列相关的遗传多样性特征数据；
（6）数据统计和分析，采用统计学方法对电泳结果进行数据统计和分析，探究猪种间的遗传多样性差异和相关性。
3.2研究方法
采集样本：在甘肃地区的养殖场、农户家庭以及市场等地采集不同品种、不同生长阶段的猪肉样品。
提取DNA：采用DNeasyBlood&TissueKit等产品提取猪DNA样品。
筛选微卫星标记：利用公共微卫星唯一性和缩短指纹方法筛选微卫星标记。
PCR扩增：使用特异性引物进行PCR扩增，扩增反应体系为20μl，PCR条件为94℃预变性3min，94℃变性30s，58℃退火45s，72℃延伸60s，共扩增35个循环，72℃末端延伸10min。
电泳检测：利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR扩增产物进行检测和分离。
数据统计和分析：对电泳结果进行统计和分析，在Excel软件中统计微卫星长度、多样性指数等遗传多样性的参数信息，使用SPSS19.0和PAST3.20软件进行主成分分析和聚类分析。
四、研究意义和预期成果
本研究将深入了解和探究甘肃地区常见猪种间的遗传多样性特征，透过繁殖等行为对猪种进行分类，有助于设立我国猪种的分类系统，并推进猪种的保护和改良，促进我国猪的可持续发展。同时，针对不同品种的遗传特征，我们还能够针对性地推行各项繁殖、抗病等人工措施，以提高猪的生长速度和肉质品质等方面，有助于我国猪肉等出口产品的国际竞争力。
预期成果：
(1)甘肃地区常见猪种的遗传多样性；(2)每个分子遗传学分析的微卫星组；(3)养殖场主和农户所提供的养殖方法或其他环境变量；(4)研究过程中所使用的统计模型、图片、数据等信息。（5）论文发表