陕南水牛微卫星DNA遗传多样性研究.doc

陕南水牛微卫星DNA遗传多样性研究王斌1,2，昝林森1,3[收稿日期]2023-01-17[基金项目]国家“十一五”科技支撑计划项目（2023BAD14B07）；西北农林科技大学拔尖人才支持计划项目[作者简介]王斌（1979—）男，陕西城固人，讲师，硕士，重要从事生物技术与家畜育种研究。E－mail：[通信作者]昝林森（1963—），陕西扶风人，专家，博士生导师，重要从事牛遗传育种与繁殖研究。E－mail：，杨彦杰4，钟昕1，黄磊1，王洪宝1,3（1西北农林科技大学动物科技学院，陕西杨凌712100；2汉中职业技术学院农林系，陕西汉中723000；3国家肉牛改良中心，中国杨凌7121004；4河南师范大学生命科学学院，河南新乡453007）[摘要]【目的】分析4个陕南水牛群体的遗传多样性，为陕南水牛品种的资源保护和开发运用提供支持。【方法】运用10对微卫星引物，采用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术，对192头陕南水牛（分别采自城固、南郑、宁强和汉滨4个群体，每群体48头）进行了遗传多样性检测，记录了各群体的等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数（Ne）、遗传杂合度（H）、各群体间的奈氏标准遗传距离及多态信息含量（PIC），根据遗传距离进行了聚类分析。【结果】4个陕南水牛群体在10个微卫星位点共发现104个等位基因，其中有8个特有等位基因，等位基因频率为0.0052～0.3490，总群体各位点平均有效等位基因数为4.0174～13.1469；10个微卫星位点平均多态信息含量为0.7007～0.8932，均为高度多态；平均杂合度为0.7550～0.9288。聚类分析结果显示，城固群体与南郑群体一方面聚在一起，然后依次同宁强、汉滨水牛群体聚在一起。【结论】10对微卫星标记可作为有效的遗传标记用于陕南水牛遗传多样性的分析；陕南水牛群体变异限度多样性丰富，选育限度较低；聚类分析结果符合陕南水牛的地理分布格局和产区的自然环境，4个群体之间遗传差异较小,遗传一致性限度较大。[关键词]陕南水牛；微卫星；遗传多样性[中图分类号][文献标记码]A[文章编号]StudyongeneticdiversityofmicrosatelliteDNAinShaannanbuffaloWANGBin1,2,ZANLin-sen1,3,YANGYan-jie4,ZHONGXin1,HUANGLei1,WANGHong-bao1,3(1CollegeofAnimalScienceandTechnology，NorthwestA&FUniversity，Yangling，Shaanxi712100,China；2A&FDepartment，HanzhongVocationandTechnologyCollege，Hanzhong,Shaanxi723000,China；3NationalBeefCattleImprovementCenterinChina,Yangling,Shaanxi712100,China;4CollegeofLifeSciences,HenanNormalUniversity，Xinxiang，Henan453007,China)Abstract:【Objective】ToanalysegeneticdiversityoffourlandracesbuffaloinsouthernShaanxiandtoprovidesupportfortheprotectionandutilizationofresourcesofbuffalospeciesinsouthernShaanxi.【Method】192ShaannanBuffalo（wereselectedfromChenggu,Nanzheng,NingqiangandHanbin）wereusedtodetectthegeneticdiversity,andcountedallelefrequencyofeachgroup,numberofalleles,effectivenumberofalleles(Ne),heterozygosity(H),betweengroupsNei'sstandardgeneticdistanceandthepolymorphicinformationcontent(PIC),analysizegeneticdistancethroughclusteranalysis.【Result】Theresultsindicatethatthereare104allelesand8alleles-specificat10microsatellitelocusin4localbuffalopopulations.Theallelefrequencies;av