hTERT沉默后消减文库的构建及初步分析的任务书.docx

hTERT沉默后消减文库的构建及初步分析的任务书
任务题目：hTERT沉默后消减文库的构建及初步分析
任务目标：通过构建hTERT沉默后消减文库，筛选出表达受到调控的基因，并初步分析其生物学功能与参与的通路，为深入研究肿瘤相关基因的调控机制提供数据支持。
任务内容：
1.hTERT沉默后消减文库的构建
(1)筛选合适的细胞系进行实验，并进行细胞株的冻存和扩增，以备进行后续实验。
(2)针对hTERT基因，设计并合成合适的siRNA，转染至细胞株中，进行沉默实验。
(3)通过RNA提取、纯化等步骤，提取细胞株中的RNA，建立hTERT沉默后消减文库。
2.文库质检和测序
(1)对建立的hTERT沉默后消减文库进行质量检测。
(2)选择合适的测序平台进行高通量测序，并保证数据准确性和可靠性。
3.数据分析和结果解读
(1)对测序数据进行质控和过滤，获得高质量的RNA测序数据。
(2)对RNA测序数据进行比对和定量分析，得到差异表达的基因列表。
(3)对差异表达基因进行KEGG通路富集分析和GO功能注释分析，并比较分析差异表达基因间的相互作用网络。
(4)结合已有文献和数据库对差异表达基因进行生物学功能和调控机制解读。
预期结果：
(1)成功构建hTERT沉默后消减文库，获得RNA测序数据，并对数据进行质量评估和质量过滤。
(2)通过比对和定量分析，筛选出表达受到调控的差异基因，并进一步进行KEGG通路富集分析和GO功能注释分析。
(3)分析差异基因在相互作用网络中的交互关系和生物学功能，并初步解读其参与的调控机制和通路。
(4)提供数据支持和分析结果，为后续深入研究肿瘤相关基因的调控机制提供基础信息。