三疣梭子蟹基因组串联重复序列分析及微卫星标记的初步筛选的任务书.docx

三疣梭子蟹基因组串联重复序列分析及微卫星标记的初步筛选的任务书
任务名称：三疣梭子蟹基因组串联重复序列分析及微卫星标记的初步筛选
任务背景：
三疣梭子蟹（Portunustrituberculatus）是我国重要的经济水产动物之一，具有食用、药用等多种价值，近年来其养殖规模不断扩大。基因组信息的获取和分析对于进一步研究三疣梭子蟹的生物学特性以及改良其养殖性状具有重要意义。其中，串联重复序列和微卫星标记的分析可以为进一步进行分子遗传学和遗传图谱的构建提供基础。
任务目标：
本任务旨在对三疣梭子蟹的基因组序列进行串联重复序列分析，并利用筛选出的串联重复序列进行微卫星标记的初步筛选，为后续进一步研究提供基础。
任务具体内容：
1.对三疣梭子蟹基因组序列进行串联重复序列分析，包括简单重复序列、复杂重复序列等。
2.筛选出具有多态性和可靠性的微卫星标记，并进行初步设计。
3.对筛选出的微卫星标记进行PCR扩增，并进行聚合物酶链式反应（PCR）产物检测及分析。
任务成果：
1.三疣梭子蟹基因组中串联重复序列的筛选和分析报告。
2.筛选出的微卫星标记序列及设计报告。
3.筛选出的微卫星标记PCR扩增和检测报告。
参考文献：
1.詹立宏,陈振中,陈淑华等.三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)基因组大小及组装质量分析[J].食品研究与开发,2019(12):107-111+117。
2.黄贵宾,李悠一,刘腾.基于转录组的大马哈鱼微卫星标记SSR分析[J].水产科学,2011,30(11):65-69。