大菱鲆(Turbot)微卫星标记的筛选与应用的任务书.docx

大菱鲆(Turbot)微卫星标记的筛选与应用的任务书
任务书
任务名称：大菱鲆(Turbot)微卫星标记的筛选与应用
任务背景：
近年来，微卫星分子标记在种系鉴定、遗传流行病学、种群遗传学等方面得到了广泛的应用。大菱鲆(Turbot)因其肉质鲜美、且营养价值高，被广泛地应用于餐桌上。然而，现有的大菱鲆标记研究只局限于对其基因组中SNPs（单核苷酸多态性）与SSR（微卫星）位点分析，尚未有文献报道对大菱鲆基因组中的微卫星标记进行筛选和应用的研究，因此未来对于大菱鲆微卫星标记的研究将具有很高的实际价值。
任务目标：
1.通过大菱鲆基因组可利用区的分析，筛选出具有多态性的微卫星标记。
2.通过PCR扩增、电泳分析等方法，确定筛选出的微卫星标记的位点信息，并对其进行多态性鉴定。
3.对筛选出的微卫星标记进行遗传连锁图、群体遗传结构和种系鉴定等研究。
任务内容：
1.大菱鲆基因组可利用区的分析
（1）从大菱鲆中提取DNA，并通过建库测序和组装鉴定大菱鲆基因组可利用区。
（2）利用MISA软件筛选出大菱鲆基因组中的微卫星标记，并进行比对。
2.微卫星标记位点的确定与多态性鉴定
（1）设计合适的引物，对筛选出的微卫星标记进行PCR扩增，并在琼脂糖凝胶上进行电泳分析，以确定微卫星标记的位点信息。
（2）选取不同的样本，测定微卫星标记在其基因组中的多态性。
3.微卫星标记在大菱鲆遗传连锁图、群体遗传结构和种系鉴定的应用
（1）利用筛选出的微卫星标记，绘制大菱鲆遗传连锁图。
（2）选取不同的种群，测定微卫星标记在其基因组中的频率，并确定不同种群之间的遗传差异。
（3）通过微卫星标记的多态性，进行大菱鲆的种系鉴定和相关研究。
任务时间：
本任务时间为6个月，自XX年XX月XX日开始至XX年XX月XX日结束。
任务经费：
本任务经费为XX万元，其中包括耗材及设备维护费、管理费、研究人员工资等费用。
任务人员：
本任务所需人员为：
1.主要研究人员：2人，分别负责基因组可利用区分析、PCR扩增、电泳分析和遗传学应用的研究等任务。
2.实验助手：2人，分别负责DNA提取、PCR试管配置、琼脂糖凝胶制备和槽电泳等实验操作。
3.数据分析人员：1人，负责遗传连锁图的制作和群体遗传结构的分析等任务。
任务报告：
1.任务结束后，应提交一份完整的研究报告，详细描述研究过程和实验结果，并解释实验结果的重要性和应用前景。
2.按照要求撰写实验过程、数据分析和结论的三个部分的相关论文，并在权威的SCI或SSCI杂志上发表。