基于基因表达谱的数据挖掘方法研究的中期报告.docx
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基于邻接谱分解的基因表达谱数据分类研究的中期报告1.介绍基因表达谱数据分类是生物信息学领域的重要问题之一。邻接谱分解是一种新的机器学习方法,能够有效地解决图像识别、自然语言处理等领域中的分类问题。本研究旨在探索邻接谱分解方法在基因表达谱数据分类中的应用。2.数据集本研究使用了公开的基因表达谱数据集GSE2034,该数据集包含了1091个样本,每个样本包含22283个基因表达量数据。这些样本分为两类,即乳腺癌组织和正常组织。3.方法本研究采用邻接谱分解方法对基因表达谱数据进行分类。具体步骤如下:(1)构建邻
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基于基因表达谱的肿瘤放疗敏感基因识别方法研究的中期报告本项目基于肿瘤的基因表达谱数据,旨在开发一种能够快速准确地预测肿瘤对放疗敏感性的方法。以下是中期报告的主要内容:1.数据预处理我们收集了大量的肿瘤组织样本,并使用RNA测序技术获得了它们的基因表达谱数据。为了进行下一步的分析,我们先对原始数据进行了初步的预处理。具体地,我们进行了质量控制、去除低表达基因、归一化和批次效应校正等步骤,以确保数据的质量和可靠性。2.特征选择在得到高质量的基因表达谱数据之后,我们进行了特征选择,以选取对放疗敏感性具有显著影响