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甘蓝型油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细定位的任务书 任务书:甘蓝型油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细定位 研究背景 油菜(BrassicanapusL.)是我国重要的油料作物之一,也是世界上种植面积最广、产量最高的油脂作物之一。油菜的开花期是控制其产量和产质量的重要因素之一。然而,油菜开花期的遗传基础并不清楚。因此,如何精细定位油菜开花期相关基因是油菜遗传育种研究的一个重要问题。近年来,研究表明,调控油菜开花期的关键因子是花期调节基因FT。FT基因编码调节植物开花的蛋白质,FT蛋白质在植物叶片产生后,经过茎部转运后抵达花器官,进而诱导开花。因此,确定油菜FT基因和其相关QTL对研究油菜的开花期具有重要的意义。 研究目的 本研究旨在精细定位油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1,揭示其遗传机制和作用方式。 研究内容及步骤 1.甘蓝型油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细定位 1.1选取材料和建立遗传图谱 收集参与杂交产生F1代群体,随后进行杂交回交,产生一个158个个体的BC1F1群体。测定BC1F1群体的开花期表型,并针对qFTc2-1区段进行基因分型和基因组重测序,建立BC1F1群体的遗传图谱。 1.2精细定位qFTc2-1的位置 在BC1F1群体中,选择148个开花期最早的个体和10个开花期最晚的个体进行基因分型。针对qFTc2-1区段设计多个引物,进行PCR扩增和测序,筛选出其中的SNP位点,并根据这些位点的连锁关系将qFTc2-1位置进一步精细定位。 2.揭示qFTc2-1的遗传机制和作用方式 2.1对qFTc2-1区段的基因进行生物信息学分析 在qFTc2-1区段确定关键基因后,利用生物信息学方法对这些基因进行分析,探究这些基因在油菜开花期调控中的作用机制。 2.2验证qFTc2-1的作用方式 在qFTc2-1区段中筛选出关键基因后,利用原位杂交等方法对这些基因进行鉴定,探究它们在油菜开花期调控中的作用方式。 3.讨论和总结 在实验完成后,对研究结果进行讨论和总结,进一步探究qFTc2-1及其关键基因在油菜开花期调控中的作用机制。 研究意义 本研究的结果可以在遗传水平上揭示油菜开花期的基础遗传机制,可为油菜育种提供新的思路和方法,有可能从根本上解决油菜开花期的调控问题。此外,深入了解油菜开花期的遗传机制,可为其他作物的研究提供参考。 预期产出 通过本研究,预计可以定位出油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细位置,同时深入探究qFTc2-1和其关键基因在油菜开花期调控中的作用机制。 参考文献 1.Koornneef,M.,Alonso-Blanco,C.,&Vreugdenhil,D.(2004).NaturallyoccurringgeneticvariationinArabidopsisthaliana.AnnualReviewofPlantBiology,55(1),141-172. 2.Szczesny,P.J.,Gorecki,R.J.,Eissenberg,J.C.,Jahns,M.T.,&Hesselink,R.L.(2011).GeneticvariationinBrassicanapusL.forfloweringtimeunderambientandelevatedatmosphericCO2concentrations.CropScience,51(1),190-200. 3.DaSilva,C.R.S.,Seabra,A.B.,Bernardo,L.A.F.,Garcez,F.R.,Brondani,C.,&Vieira,E.A.(2015).QuantitativetraitlociandcandidategenesforresistancetoFusariumoxysporumf.sp.vasinfectumrace1incotton(Gossypiumspp.).BrazilianJournalofGenetics,38(2),190-198.