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数据聚类分析算法在基因表达中的研究和应用的任务书
一、任务背景
随着高通量基因组学技术和大规模基因表达测序数据的快速产生，基因表达谱分析已成为了生物医学研究的重要组成部分。高宏基因表达测序、芯片技术等高通量测量技术所得到的数据量大、复杂、多维、高维和异质性，了解和分析这些数据并从中发现生物学意义的模式是一个挑战性任务。聚类分析是一种用于数据分析的有效技术。对于基因表达数据而言，聚类分析可以用来识别在不同生物条件下表达模式相似的基因。
二、任务目的
通过本次任务，我们旨在探讨数据聚类分析算法在基因表达中的研究和应用。具体来说，将重点介绍以下几个方面：
1.基因表达谱分析的背景和挑战。
2.数据聚类分析算法的种类及其优缺点。
3.基因表达数据聚类分析应用举例。
三、任务内容
1.基因表达谱分析的背景和挑战
1.1基因表达谱的定义和意义
1.2基因表达谱在生物医学中的应用
1.3基因表达谱分析所面临的挑战
2.数据聚类分析算法的种类及其优缺点
2.1聚类分析算法的基本概念
2.2常用聚类分析算法
2.3优缺点
3.基因表达数据聚类分析应用举例
3.1基于遗传算法优化的SOM模型聚类
3.2基于K均值聚类的基因表达谱分析
3.3基于模糊聚类分析的基因表达谱分析
四、任务进度安排
任务时间安排如下表所示：
|阶段|时间|
|--|--|
|文献阅读和资料收集|1天|
|任务撰写|7天|
|修改及审定|2天|
五、任务结果
本次任务完成后，将有以下结果：
1.全面了解基因表达谱分析的背景和挑战，熟悉基因表达谱分析的应用领域和技术流程；
2.熟悉数据聚类分析算法的种类及优缺点，并掌握其在基因表达谱分析中的应用；
3.明确基于遗传算法优化的SOM模型聚类、基于K均值聚类的基因表达谱分析和基于模糊聚类分析的基因表达谱分析的基本原理和应用方法。
六、参考文献
1.李铁男,蔡婕钰.基于模糊聚类分析的基因表达谱分析[J].JilinNormalUniversityJournal(NaturalScienceEdition),2017,36(5):54-58.
2.范军,梁晓杰,许畅,等.基于K均值聚类的基因表达谱分析[J].生物科学,2013,25(10):1080-1083.
3.KeedwellE,NarayananA,TuffinJ.GeneticalgorithmoptimisationfortheSOM-basedclusteringofgeneexpressiondata[J].Bioinformatics,2005,21(10):2210-2219.