用于制备测序设备的系统和方法.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN110835646A(43)申请公布日2020.02.25(21)申请号201910759020.X(22)申请日2019.08.16(30)优先权数据62/719,0782018.08.16US62/719,0812018.08.16US62/885,6682019.08.12US(71)申请人生命技术公司地址美国加利福尼亚州(72)发明人H.于X.杨R.郑C.T.A.王J.格雷(74)专利代理机构北京市柳沈律师事务所11105代理人张邦帅(51)Int.Cl.C12Q1/6869(2018.01)权利要求书2页说明书23页附图16页(54)发明名称用于制备测序设备的系统和方法(57)摘要本公开一般涉及用于磁珠加载的系统，方法和装置。本公开的一个示例性实施例涉及将磁珠与测序珠子混合以形成溶液。将含有两种珠子的溶液注射到具有多个微井的微芯片上。磁珠可以具有比微井更大的直径，而测序珠子可以具有更小的直径，允许它们进入并存在于微井中。位于微芯片下方的一个或多个磁体在微芯片表面上来回移动。磁珠形成一条线并跟随磁体的运动。在扫描轮次期间，测序珠子加载到相应的井中。在加载测序珠子之后可以使磁体脱离并且可以洗掉磁珠。CN110835646ACN110835646A权利要求书1/2页1.将珠子支持物加载到基板的多个反应井中的反应井中的方法，每个反应井在基板的第一表面处具有入口开口，所述方法包括：将具有多个珠子复合物的悬浮液引入到基板上，所述多个珠子复合物中的珠子复合物包括与珠子支持物偶联的磁珠；使磁性装置平行于基板的第二表面移动，第二表面与第一表面相对，磁珠被吸引到第一表面，珠子支持物进入多个反应井中的反应井；将磁珠与珠子支持物分离；以及将磁珠从基板上洗掉。2.根据权利要求1所述的方法，其中，磁珠的珠子直径大于多个反应井的开口，并且其中珠子支持物的珠子直径小于多个反应井的开口。3.根据权利要求1所述的方法，其中，磁性装置包括由惰性材料分开的一对磁体。4.根据权利要求3所述的方法，其中，该对磁体中的第一磁体具有邻近基板的第二表面设置的北极，并且该对磁体中的第二磁体具有邻近基板的第二表面设置的南极。5.根据权利要求1所述的方法，其中，珠子支持物是其上具有多核苷酸的测序珠子。6.根据权利要求5所述的方法，还包括扩增多核苷酸以在测序珠子上提供多核苷酸的多个拷贝。7.根据权利要求5所述的方法，还包括对附着于基板的反应井中的珠子支持物的多核苷酸进行测序。8.根据权利要求1所述的方法，其中，使磁性装置平行于基板的第二表面移动包括使磁性装置沿平行于基板的第二表面的不同方向移动。9.根据权利要求1所述的方法，其中，珠子支持物与多核苷酸偶联，所述多核苷酸具有设置在珠子支持物远侧的接头部分，磁珠具有互补接头部分，当珠子支持物的接头部分与磁珠的互补接头部分连接时形成珠子复合物。10.根据权利要求9所述的方法，其中，具有接头部分的多核苷酸与共价结合至珠子支持物的第二多核苷酸杂交，其中将磁珠与珠子支持物分离包括将多核苷酸与第二多核苷酸分离。11.根据权利要求10所述的方法，其中，将多核苷酸与第二多核苷酸分离包括用低离子强度水溶液洗涤。12.根据权利要求10所述的方法，其中，将多核苷酸与第二多核苷酸分离包括加热基板。13.根据权利要求1所述的方法，还包括：产生模板核酸，其包括捕获序列部分、模板部分和用接头部分修饰的引物部分；在珠子支持物上捕获模板核酸，珠子支持物具有与模板核酸的捕获序列部分互补的多个捕获引物，捕获引物与模板核酸的捕获序列部分杂交；以及将捕获的模板核酸链接到具有第二接头部分的磁珠以形成珠子复合物，第二接头部分附着到第一接头部分。14.根据权利要求13所述的方法，还包括延伸与模板核酸互补的捕获引物，以形成附着于珠子支持物的序列靶核酸。15.根据权利要求14所述的方法，还包括使模板核酸和序列靶核酸变性以从珠子支持2CN110835646A权利要求书2/2页物释放磁珠。16.根据权利要求15所述的方法，其中，变性包括酶促变性。17.根据权利要求15所述的方法，其中，变性包括在离子溶液存在下变性。18.根据权利要求15所述的方法，还包括扩增序列靶核酸以在反应井中的珠子支持物上形成序列靶核酸群。19.根据权利要求18所述的方法，其中，扩增包括进行重组酶聚合酶扩增(RPA)。20.根据权利要求19所述的方法，其中，执行RPA包括执行第一时段的RPA、洗涤、执行第二时段的RPA，第一时段比第二时段短。21.根据权利要求13所述的方法，其中，产生包括延伸与靶核酸互补的接头修饰的引物。22.根据权利要求13所述的方法，其中，所述产生包括在具有捕获引物、与第一引物部分互补的接头修饰的第一引物和第二引