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基因克隆载体基因克隆载体的特点2克隆载体的分类2.2按克隆载体的用途分类第二节质粒克隆载体细胞内:超螺旋环状共价双链DNA分子 细胞外:超螺旋、开环,线形质粒DNA分子的大小:细菌质粒的大小相差较大,小的仅不足1kb,大的可达数百kb. 不相容性(Incompatible):两种类似的但又不同的质粒不能存在于同一细胞中. 可转移性:质粒可通过接合作用等方式转移到新的宿主细胞中. 复制性:质粒DNA分子只在宿主细胞内进行单向复制,其复制受质粒本身和宿主细胞遗传系统的双重控制,质粒提供复制的起始位点和核苷酸的序列.质粒上的相关基因2几种常见的质粒载体2)pUC18-19:含有pBR322的Apr基因和复制的起始点,部分缺失的Lac操纵子片段,并在LacZ’区组装了MCS.pUC18-19多克隆位点3)pBluescriptM13:含有M13噬菌体DNA复制起点的载体,该起点以互为相反方向插入到含有T3和T7噬菌体启动子的一个来自pUC质粒的载体当中.4)Ti质粒载体人们很早就发现双子叶植物常发生一种冠瘿瘤病,该病在法国、东欧和意大利的葡萄和果树上曾大面积发生。1907年 Smith和Townsent等 首先发现这种冠瘿瘤 病是由根癌农杆菌 引发的。1、T-DNA区:转移DNA,农杆菌侵染细胞时,从Ti质 粒上切割下来转移到植物细胞上的一段DNA 2、Vir区:毒区,激活T-DNA转移。与T-DNA区相邻, 二者共占Ti质粒DNA的1/3。 3、Con区:接合转移编码区,该区存在着与细菌间接 合转移的有关基因(tra),调控Ti质粒在 农杆菌之间的转移。 4、Ori区:复制起始区 病毒区基因及功能Ti质粒T-DNA的边界序列3质粒载体的构建3.2pBR322质粒载体的构建3.3pUC18-19质粒载体的构建pUC18-19的构建筛选重组子的示意图利用菌落颜色筛选重组子3.4蓝藻质粒载体的构建蓝藻质粒载体pAQE17的构建3.5农杆菌Ti质粒载体的构建外源片段共整合到Ti质粒上的过程双向载体:由两个以上的质粒构建而成.将Ti质粒的Vir与广宿主范围质粒的携带目的基因(MCS)、选择性标记、转移和复制功能整合在一起.双向载体可在大肠杆菌和农杆菌中进行复制并稳定存在下去.第三节噬菌体衍生的克隆载体a)在噬菌体内呈线性双链DNA分子(48502bp) 在两端各有12个碱基组成的5’单链互补粘 性末端(Cohesiveend),进入宿主细胞后, 粘性末端连接形成环状分子(Cos位点). 5’-GGGCGGCGACCTXX…XXG-3’ XX…XXCCCCGCCGCTGGA-5’ b)λ基因组DNA上有多种限制酶识别位点. c)λ噬菌体包装DNA的大小为原λDNA长度的 75-105%(38-54kb).1.2λ基因组DNA的结构噬菌体的组装1.3λ噬菌体载体构建的策略常用的λ噬菌体衍生载体2.Cosmid克隆载体2.2部分Cosmid载体3.M13衍生的克隆载体3.2M13DNA的复制与M13噬菌体的增殖3.3M13衍生的克隆载体第四节植物病毒载体1)CaMV-DNA的一般特性花椰菜花斑病病毒DNA缺口的结构CaMVDNA分子上有八个开放阅读框(ORF)和三个间隔区. ORFI:编码运动蛋白,负责CaMV在细胞间运转. ORFII:表达产物与蚜虫口针或前肠的特殊位点 相结合,参与蚜虫的感染. ORFIII:编码病毒结构蛋白. ORFIV:编码外壳蛋白. ORFV:编码逆转录酶. ORFVI:宿主范围,病害的发生和症状的出现等密切相关。 ORFIII:功能不清楚. ORFIV:功能不清楚.病毒增殖3)CaMVDNA的间隔区CaMV35S启动子序列4)CaMV-DNA限制性内切酶识别位点CaMV(CabbB-S)DNA的部分酶切位点5)CaMV-DNA的存在状态与感染能力6)CaMV的转录复制与CaMV的增殖7)CaMV-DNA克隆载体的构建互补载体系统混合载体系统2.烟草花叶病毒(TMV)克隆载体TMV的结构特征TMV克隆载体构建的策略475/476ALSV-RNA2(3385nt)接種葉第五节动物病毒基因克隆载体1)SV40DNA的一般特性 SV40DNA为环状双链DNA(5243bp),与宿主细胞组蛋白H4,H2A,H2B和H3结合,组成念珠状核小体-微型染色体(mini-chromosome) SV40DNA编码两个基因区,早期转录区和晚期转录区,分别以相反的方向转录SV40基因转录图SV40DNA单识别位点限制性内切酶位点2)SV40-DNA的转录、复制与增殖3)SV40DNA衍生的克隆载体的构建SV40DNA晚期转录区取代型载体重组病毒质粒载体2.腺病毒克隆载体腺病毒结构腺病毒DNA的结构腺病毒克隆载体的构建第五节反转录病