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!"卷!期微生物学报&’()!"/’)! #$$"年%月!"#$%&"’()&(*(+&"$,&-&"$*+,+-.#$$" !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 稗草致病菌———尖角突脐孢菌菌株!"#$指纹图谱的分析 陈勇0倪汉文#" (0解放军军需大学农副业生产系长春0"$$7#) (#中国农业大学农学与生物技术学院农药与植物检疫系北京0$$$3!) 摘要:以我国主要稻区的稗草植株上分离的04株尖角突脐孢菌菌株为试验材料,采用改良 的GHG法提取其基因组H/*,并运用优化的I*JH分析体系对其进行了分子标记遗传差异研 究。从#2个随机引物中筛选出#$个扩增效果好的引物,对全部试验材料进行了I*JH扩增, 共得到#"3条有效带,其中多态性带##3条(占32)%K)。依据扩增结果建立了04株尖角突脐 孢菌基因型的H/*指纹图谱并对其进行了有效区分。根据I*JH分析结果计算了菌株间的 遗传距离,分析了它们的遗传差异并进行了聚类分析,结果表明,I*JH分子标记技术是能够 用于杂草致病菌资源的鉴定的,并可以进一步应用于特定性状的基因标记研究。 关键词:尖角突脐孢菌,I*JH分析,指纹图谱,遗传差异,菌株鉴定 中图分类号:L3"3E7!文献标识码:*文章编号:$$$087#$3(#$$")$!8$!$38$% 稗[!"#$%&"#’&(")*+8,(’’$(M))16:+N)]是世界十大恶性杂草之一,为水稻田危害最严 重的杂草。与水稻的伴生性强,极难清除,亦发生于潮湿旱地,危害棉花、大豆等秋熟旱作 物。目前主要采用化学防除稗草。利用真菌除草剂防治稗草将是一条有效的新途径。经 [] 研究发现尖角突脐胞菌(!-+.)&#$’*//&%&".)(+)具有作为防除稗草的潜力0O"。 真菌,是一种遗传多样性很丰富的生物种群,不同生态型、不同地域、以及不同时期分 离的真菌,它们的遗传特性表现不同,而且种内变异很大,使得真菌在形态分类鉴定上十 分困难。对真菌菌种种下的分类鉴定,可采用传统的形态学、生理生化特性、免疫学和同 工酶等手段[!];通过病理学手段,研究其专化型,分离鉴别出专化型毒素[2]。在菌种内菌 株间分类鉴定需要极其专业的技术人员,而且很难做到简单快速,至今尚无一个通用、高 效、简便的鉴定方法。 [] 近年来分子生物学技术的不断发展和完善,H/*指纹图谱应运而生7,把种质资源 的研究提高到一个新水平。其中H/*随机扩增产物多态性(I:@D’=*=P(>Q>6DJ’(F=’RP?>C H/*,简称I*JH)分子标记技术,已成为近年来发展最快、应用最广的一种标记技术。提 出后短短几年中已广泛应用于连锁标记检测主基因、建立遗传图谱、确定染色体的同源发 生、基因的染色体定位、图谱分析以及分类、杂种和品种的鉴定等方面[7]。这些技术很快 应用到微生物分类鉴定上[4],但是应用于真菌除草研究还不多[%]。目前这方面的研究很 基金项目:国家“十五”攻关项目(#$$01*2$31$4) "通讯作者。56(:%780$87#%30"$#;9:;:%780$87#%30$22;<8=:>(:?:@A6@@>BC:+)6D+)C@ 作者简介:陈勇(0373E),男,江西石城人,讲师,博士,主要从事微生物除草剂研究。<8=:>(:C?F,,BF:?’’)C’= 收稿日期:#$$#80$8#0,修回日期:#$$"8$"8#4 .!<微生物学报.#卷 薄弱,亟待进一步加强研究和解决。分子生物学技术作为一种功能强大的实验手段,如广 泛应用于微生物除草剂的菌种改良、生物测定及环境风险评价等方面,将会极大地加快微 生物除草剂的研发速度,更多的微生物除草剂产品服务于人类。本试验试图通过研究建 立一种简单、快捷、自动化程度高的方法以鉴定稗草致病真菌菌种资源。 !材料和方法 !"!菌株 试验材料为尖角突脐孢菌真菌,分离自吉林、黑龙江、北京、湖北、江西、广东、贵州、山 东、江苏等地采集稗草具病斑的叶片上。试验用的!"个菌株为:#$、%&’、%("、!)、*$"、 +,$、-.#、+*$、!/、%0!、+*.、12、0!’、3!、+,#、+*’!和4’,各菌株在马铃薯葡萄糖培养液 +%,中,$)5下振荡培养"6,使之长成菌丝团,分别取各菌株的菌丝用于提取基因组 %47。 !"#试剂和仪器 气热式+8(扩增仪:型号是9%:%8;<$-$$<,英国9=>?@6公司生产,购自生命科学 国际集团。 A@B!<碱基随机引物:其中$<个引物购自上海生工生物工程技术服务有限公司,序列 号为-<!C-$<;另外’个引物使用美国DEFGHI公司生产的,购自中国科学院遗传研究所, 序列号为HEE<!CHEE<’。