利用叶绿体标记鉴别玉米雄性不育S型胞质类型.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN108192991A(43)申请公布日2018.06.22(21)申请号201810117270.9(22)申请日2018.02.06(71)申请人北京市农林科学院地址100097北京市海淀区曙光花园中路9号(72)发明人王凤格田红丽赵久然许理文杨扬王蕊易红梅任洁王璐(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002代理人王文君陈征(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书5页说明书11页序列表16页附图2页(54)发明名称利用叶绿体标记鉴别玉米雄性不育S型胞质类型(57)摘要本发明提供了一种利用叶绿体标记鉴别玉米雄性不育S型胞质类型，本发明的叶绿体标记是基于叶绿体基因组开发得到，共有20个分子标记，包括17个SNP和3个InDel标记。该分子标记组合可用于鉴定玉米S型雄性不育胞质和正常胞质的种质材料，可用于鉴定S型不育制种和常规制种的杂交种，还可用于鉴定S型不育材料的纯度。本发明提供的分子标记组合为玉米S型细胞质不育制种、不育材料选育提供了鉴定技术支持，为玉米三系配套种子生产提供了强有力保障；在基因组水平上拓展了玉米可用标记位点的范围，为玉米细胞质遗传特性等研究提供了新的思路和方法。CN108192991ACN108192991A权利要求书1/5页1.用于鉴别玉米雄性不育S型胞质类型的分子标记，其特征在于，其包括以下20个分子标记中的任一或多个分子标记组合，所述20个分子标记为17个SNP分子标记和3个InDel分子标记，它们的信息如下：2CN108192991A权利要求书2/5页3CN108192991A权利要求书3/5页4CN108192991A权利要求书4/5页2.如权利要求1所述分子标记其特征在于，除位点编号为CPMIDP11的分子标记外，其他分子标记分别通过以下引物扩增得到：CPMSNP08，SEQIDNO.41-43；CPMSNP09，SEQIDNO.44-46；CPMSNP10，SEQIDNO.47-49；CPMSNP12，SEQIDNO.50-52；CPMSNP26，SEQIDNO.53-55；CPMSNP28，SEQIDNO.56-58；CPMSNP31，SEQIDNO.59-61；CPMSNP33，SEQIDNO.62-64；CPMSNP37，SEQIDNO.65-67；CPMSNP45，SEQIDNO.68-70；CPMSNP49，SEQIDNO.71-73；CPMSNP52，SEQIDNO.74-76；CPMSNP60，SEQIDNO.77-79；CPMSNP65，SEQIDNO.80-82；CPMSNP66，SEQIDNO.83-85；CPMSNP79，SEQIDNO.86-88；CPMSNP96，SEQIDNO.89-91；CPMIDP01，SEQIDNO.92-95；CPMIDP02SEQIDNO.96-98。3.权利要求1或2所述分子标记在鉴定玉米S型胞质雄性不育系配制的杂交种中的应用。4.权利要求1或2所述分子标记在鉴定S型胞质雄性不育玉米材料中的应用。5.权利要求1或2所述分子标记在玉米分子标记辅助育种中的应用。6.权利要求1或2所述分子标记在玉米种质资源鉴定中的应用。7.根据权利要求3-6任一所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：1)提取待测玉米样品的DNA；2)以步骤1)提取的DNA为模板，根据权利要求1或2所述分子标记，基于KASP检测平台技术分别设计引物，进行PCR扩增；3)采用荧光检测仪分析PCR产物。8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，步骤2)PCR扩增程序为：94℃15min；94℃20s，61℃1min，循环10次，每个循环降低0.6℃；94℃20s，58℃1min，循环30次。9.权利要求1所述分子标记在鉴定S型胞质雄性不育玉米材料纯度中的应用。10.如权利要求9所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：1)提取待测玉米样品的DNA；2)以步骤1)提取的DNA为模板，根据权利要求1或2所述分子标记，基于KASP检测平台技术分别设计引物，进行PCR扩增；3)采用荧光检测仪分析PCR产物；4)若PCR产物如果与所述等位基因相同则为S型不育单株，如果为另一个等位基因则不5CN108192991A权利要求书5/5页属于S型不育单株；每个位点均进行纯度计算，计算方法为：(S型不育单株数目/检测的总单株数目)×100％。6CN108192991A说明书1/11页利用叶绿体标记鉴别玉米雄性不育S型胞质类型技术领域[0001]本发明属于农作物分子生物学技术领域，具体地说，涉及利用叶绿体标记鉴别玉米雄性不育S型胞质类型。背景技术[0002]