一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记R112865-1及应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN109797237A(43)申请公布日2019.05.24(21)申请号201811565320.6(22)申请日2018.12.20(71)申请人深圳市华大农业应用研究院地址518108广东省深圳市大鹏新区大鹏办事处鹏城社区鹏飞路7号申请人深圳华大生命科学研究院中国农业科学院深圳生物育种创新研究院(72)发明人张耕耘侯军亮鄢阳天李刚蔡伟常锋雷雪静(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表1页附图1页(54)发明名称一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记R112865-1及应用(57)摘要一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记R112865-1及应用。本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体的，涉及一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记，该分子标记含有SeqIDNo.1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻抗稻瘟病基因Pi1定位或水稻遗传育种中的用途，以及一种水稻育种方法。本发明公开的与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记、扩增引物可以对水稻抗稻瘟病基因Pi1进行良好分型，可以用于水稻抗稻瘟病的分子标记辅助育种，为实现水稻抗稻瘟病性状的早期鉴定和筛选育种提供分子辅助技术支持，对于加快水稻品种的遗传选育和改良进程具有重要的理论和实践指导意义。CN109797237ACN109797237A权利要求书1/1页1.一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记，其特征在于：所述分子标记含有SeqIDNo.1所示核苷酸序列；优选的，所述分子标记为SeqIDNo.1所示核苷酸序列。2.一种可用于扩增与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记的引物对，其特征在于扩增的目标序列包含SeqIDNo.1所示序列；优选的，所述引物对的引物1包含SeqIDNo.2所示序列，引物2包含SeqIDNo.3所示序列；更优选的，引物1为SeqIDNo.2所示序列，引物2为SeqIDNo.3所示序列。3.一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记，其特征在于：所述分子标记是由权利要求2所述的引物对以抗稻瘟病病的水稻基因组DNA为模板经PCR扩增得到的。4.根据权利要求3所述的分子标记，其特征在于：所述分子标记含有SeqIDNo.1所示核苷酸序列；优选的，所述分子标记为SeqIDNo.1所示核苷酸序列。5.权利要求1所述的分子标记的检测方法，包括步骤：根据权利要求1的分子标记的核苷酸序列设计引物，以被检测水稻基因组DNA为模板进行扩增，并判断扩增产物中是否存在该分子标记；优选的，所述引物为权利要求2所述的引物对。6.权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或权利要求2的分子标记引物对在水稻辅助育种或者水稻抗稻瘟病基因Pi1定位或检测中的用途。7.一种水稻抗稻瘟病基因Pi1定位的方法，其特征在于：所述方法包括使用权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或权利要求2的分子标记引物对的步骤。8.一种水稻辅助育种方法，其特征在于：所述方法包括检测权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或用权利要求2的分子标记引物对进行检测的步骤。2CN109797237A说明书1/6页一种与水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记R112865-1及应用技术领域[0001]本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，特别是涉及一种水稻抗稻瘟病基因Pi1紧密连锁的分子标记。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻抗稻瘟病基因Pi1定位或水稻遗传育种中的用途。背景技术[0002]水稻(Oryzasativa)是我国最重要的粮食作物之一，全国水稻种植面积约占粮食作物面积的30％，产量接近粮食总产量的一半，稻谷是我国60％以上人口的主食。[0003]稻瘟病是水稻重要病害之一，可引起大幅度减产，严重时减产40％～50％，甚至颗粒无收。稻瘟病是真菌寄生引起，稻瘟病菌主要以分生孢子和菌丝在病稻或病谷上越冬。到第二年，当温度、湿度适宜稻瘟病菌生长时，病菌就会产生大量的分生孢子，青灰色霉即是病菌的分生孢子，病害的扩展靠分生孢子在空气中传播，当分生孢子接触寄主表皮上的机动细胞后，其尖端释放的粘胶及芽胞使孢子紧密地附着在寄主上，接着分生孢子便利用自身孢子的内源营养而萌发形成发芽管，发芽管又特异性分化产生具黑色素的附着胞，附着胞产生侵染栓穿透寄主组织的角质层和表皮细胞壁，继而在寄主细胞中生长，侵染邻近表皮细胞并深入叶肉细胞，稻瘟病菌侵染水稻5～7天后出现症状，完成侵染后，被侵染的细胞又产生新的菌丝和分生孢子梗，分生孢子梗又分化出分生孢子并从病斑中释放出来，依靠气流再