与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记R112146.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN110066883A(43)申请公布日2019.07.30(21)申请号201811477187.9(22)申请日2018.12.03(71)申请人中国农业科学院深圳生物育种创新研究院地址518108广东省深圳市大鹏新区大鹏街道办事处一楼1102室申请人深圳市华大农业应用研究院深圳华大生命科学研究院(72)发明人李泽桦侯军亮李勇杨麒生伏琦倪雪梅杜国华(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书7页序列表1页附图1页(54)发明名称与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记R112146(57)摘要与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记R112146。本发明提供了一种与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记，该分子标记含有SEQIDNO：1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻白叶枯病抗性基因Xa23定位或水稻遗传育种中的用途，以及一种水稻育种方法。本发明的分子标记将基因组DNA序列与水稻白叶枯病抗性基因Xa23联系起来，有利于水稻分子标记辅助育种体系的建立；所述分子标记与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁。本发明的分子标记及分子标记扩增引物可以简便、快速、高通量地应用于水稻育种实践和资源及品种鉴定。CN110066883ACN110066883A权利要求书1/1页1.一种与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记，其特征在于：所述分子标记含有SEQIDNO：1所示核苷酸序列；优选的，所述分子标记为SEQIDNO：1所示核苷酸序列。2.一种可用于扩增与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记的引物对，其特征在于扩增的目标序列包含SEQIDNO：1所示序列；优选的，所述引物对的引物1包含SEQIDNO：2所示序列，引物2包含SEQIDNO：3所示序列；更优选的，引物1为SEQIDNO：2所示序列，引物2为SEQIDNO：3所示序列。3.一种与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记，其特征在于：所述分子标记是由权利要求2所述的引物对以抗白叶枯病的水稻基因组DNA为模板经PCR扩增得到的。4.根据权利要求3所述的分子标记，其特征在于：所述分子标记含有SEQIDNO：1所示核苷酸序列；优选的，所述分子标记为SEQIDNO：1所示核苷酸序列。5.一种载体，其特征在于：含有权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记。6.一种重组细胞，其特征在于：含有权利要求5所述的载体。7.权利要求1所述的分子标记的检测方法，包括步骤：根据权利要求1的分子标记的核苷酸序列设计引物，以被检测水稻基因组DNA为模板进行扩增，并判断扩增产物中是否存在该分子标记；优选的，所述引物为权利要求2所述的引物对。8.权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或权利要求2的分子标记引物对在水稻辅助育种或者水稻白叶枯病抗性基因Xa23定位或检测中的用途。9.一种水稻白叶枯病抗性基因Xa23定位的方法，其特征在于：所述方法包括使用权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或权利要求2的分子标记引物对的步骤。10.一种水稻辅助育种方法，其特征在于：所述方法包括检测权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或用权利要求2的分子标记引物对进行检测的步骤。2CN110066883A说明书1/7页与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记R112146技术领域[0001]本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，特别是涉及一种与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的分子标记。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻白叶枯病抗性基因Xa23定位或水稻遗传育种中的用途。背景技术[0002]水稻白叶枯病是世界上分布最广，危害最重的一种细菌病害，目前我国除新疆、西藏和东北的北部地区外，其余各省市和自治区均已发现。该病是由黄单胞杆菌属革兰氏阴性菌稻黄单胞杆菌(Xanthomonasoryzaepv.Oryzae，Xoo)侵染引起的一种寄生性病害，水稻整个生长周期都会受到侵害而发病，通常会减产20％-30％，严重时可达到50％或绝收。[0003]通过前人研究，可以发现控制白叶枯病最经济有效的方式就是培育抗病品种。传统抗病育种是根据分离群体的表现和育种者的经验进行选择，通常受环境条件、显隐性关系、基因上位等因素的影响，费时、费力、不准确。近年来生物技术的发展，尤其是分子标记技术的应用给水稻遗传育种带来了巨大变化。分子标记辅助选择为育种者提供了对目标性状进行选择的有效手段，它大大加速了育种进程，提高了育种选择效率，同时减少了盲目选择和人力、物力的大量浪费，展示出极其广