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(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114457182A(43)申请公布日2022.05.10(21)申请号202210157007.9(22)申请日2022.02.21(71)申请人广东省农业科学院蔬菜研究所地址510000广东省广州市天河区金颖路66号(72)发明人赵钢军吴海滨罗剑宁李俊星龚浩郑晓明刘小茜(74)专利代理机构广州广典知识产权代理事务所(普通合伙)44365专利代理师万志香曾银凤(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表1页附图2页(54)发明名称与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记及其应用(57)摘要本发明公开了一种与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记,所述SNP分子标记位于丝瓜第13号染色体第3016574bp碱基,该处碱基为T或C。本发明的SNP分子标记具有通用性和准确性,根据SNP分子标记和KASP引物,可以直接用于丝瓜果皮颜色和相对应的基因型的鉴定,从而在苗期就可以实现从基因型上快速、准确的判断丝瓜果皮颜色性状,提高了工作效率,为丝瓜分子育种提供有效的技术支持,具有重要的应用价值。CN114457182ACN114457182A权利要求书1/1页1.一种与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记位于丝瓜第13号染色体第3016574bp碱基,该处碱基为T或C。2.根据权利要求1所述的与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的TT基因型对应的丝瓜果皮颜色为白色,所述SNP分子标记的TC或CC基因型对应的丝瓜果皮颜色为绿色。3.一种检测丝瓜果皮颜色的引物,其特征在于,所述引物包括:序列如SEQIDNo:1所示的正向引物、以及序列如SEQIDNo:2和SEQIDNo:3所示的反向引物。4.根据权利要求3所述的检测丝瓜果皮颜色的引物,其特征在于,所述反向引物的5'端连接有荧光分子FAM或HEX。5.根据权利要求4所述的检测丝瓜果皮颜色的引物,其特征在于,所述序列如SEQIDNo:2所示的反向引物的5'端连接有荧光分子FAM,所述序列如SEQIDNo:3所示的反向引物的5'端连接有荧光分子HEX。6.一种用于丝瓜果皮颜色早期筛选的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:权利要求3~5任一项所述的检测丝瓜果皮颜色的引物。7.权利要求1或2所述的SNP分子标记、权利要求3~5任一项所述的引物、或权利要求6所述的试剂盒在丝瓜果皮颜色早期筛选中的应用。8.权利要求1或2所述的SNP分子标记、权利要求3~5任一项所述的引物、或权利要求6所述的试剂盒在丝瓜分子标记辅助育种中的应用。9.一种丝瓜果皮颜色早期筛选的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:以待测丝瓜样品的DNA为模板,进行PCR扩增,检测位于丝瓜第13号染色体第3016574bp碱基为T或C。10.根据权利要求9所述的丝瓜果皮颜色早期筛选的方法,其特征在于,所述PCR扩增为TouchdownPCR,所述TouchdownPCR扩增程序为:94℃15min;95℃20s,65℃‑57℃60s,10个循环,每个循环退火延伸温度降0.88℃;94℃20s,57℃60s,30个循环。2CN114457182A说明书1/5页与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记及其应用技术领域[0001]本发明属于分子生物学及作物育种技术领域,更具体地说,本发明涉及一种与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记、检测丝瓜果皮颜色的引物、试剂盒以及SNP分子标记、引物和试剂盒在丝瓜分子育种中的应用。背景技术[0002]丝瓜是一种重要的药食兼用的多功能蔬菜。丝瓜果皮富含维生素、氨基酸、微量元素和抗氧化物质,具有清热消暑、止血消炎的功效。近年来,随着人们对营养健康的重视,丝瓜的播种面积逐年增大,特别对于华南地区而言,丝瓜已成为广东、广西、海南、及港澳地区重要的日常消费蔬菜。[0003]丝瓜的果皮颜色是其重要的农艺性状,皮色对其市场销售有着直接影响。由于不同消费地区对丝瓜皮色的要求不尽相同,因而需要以当地的消费习惯为育种目标进行新品种选育。目前丝瓜果皮颜色的选育,只能等丝瓜果实长出来之后才知道果皮颜色,劳动成本、人工成本高,费时费力。[0004]竞争性等位基因特异PCR(KASP)技术是针对等位基因SNP位点设计的两端引物,利用实时荧光PCR技术,对底物进行扩增,相应的荧光探针可以与对应引物结合位点相结合,根据检测出的荧光颜色确定扩增产物的基因型,是一种无需电泳新型快速简便方法。[0005]因此,开发与果皮颜色紧密连锁的SNP分子标记,对丝瓜分子育种具有重要的意义。发明内容[0006]基于此,本发明的目的之一是提供一种与丝瓜果皮颜色相关的SNP分子标记,