与小麦条锈病抗性QTL QYr.sicau-6B紧密连锁的分子标记及应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114836556A(43)申请公布日2022.08.02(21)申请号202210303662.0C12Q1/6851(2018.01)(22)申请日2022.03.24A01H1/00(2006.01)A01H1/04(2006.01)(71)申请人四川农业大学A01H6/46(2018.01)地址611130四川省成都市温江区惠民路211号(72)发明人刘亚西侯帅王智强石浩然林宇陈浩武方琨李彩霞周红(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002专利代理师钱云(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)C12Q1/6858(2018.01)权利要求书1页说明书11页序列表3页附图2页(54)发明名称与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau-6B紧密连锁的分子标记及应用(57)摘要本发明涉及与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B紧密连锁的分子标记及应用，本发明提供的分子标记为KASP‑TXK‑6，其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；分子标记KASP‑TXK‑6与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B紧密连锁。本发明通过检测分析证实了，该分子标记能准确跟踪所述小麦条锈病抗性QTL，预测小麦的条锈病抗性，进而方便进行分子设计育种。对分子标记KASP‑TXK‑6进行检测能够加强小麦条锈病抗性预测的准确性，以便快速筛选出具有高抗小麦条锈病的QTL的小麦品种或品系用于育种，可大大加快小麦高产品种的选育进程。CN114836556ACN114836556A权利要求书1/1页1.与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B紧密连锁的分子标记KASP‑TXK‑6，其特征在于，所述分子标记KASP‑TXK‑6的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，在所述核苷酸序列的第25位碱基多态性为A或G。2.根据权利要求1所述的分子标记KASP‑TXK‑6，其特征在于，分子标记KASP‑TXK‑6与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B共定位于小麦6B染色体上标记KASP‑TXK‑10～KASP‑TXK‑6区段内，所述分子标记KASP‑TXK‑6位于小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B置信区间上。3.根据权利要求2所述的分子标记KASP‑TXK‑6，其特征在于，所述小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B能显著提高小麦条锈病抗性，LOD值大于3，解释17.00％的表型变异。4.根据权利要求1～3任一项所述的分子标记KASP‑TXK‑6，其特征在于，分子标记KASP‑TXK‑6的单碱基差异位点为A，对应小麦条锈病抗性强；分子标记KASP‑TXK‑6的单碱基差异位点为G，对应小麦条锈病抗性弱。5.用于扩增权利要求1～4任一项所述分子标记KASP‑TXK‑6的特异性引物组。6.根据权利要求5所述的特异性引物组，其特征在于，所述特异性引物组包括序列如SEQIDNO.2‑4所示的引物。7.根据权利要求6所述的特异性引物组，其特征在于，SEQIDNO.2与SEQIDNO.3所示的引物的5’端分别连有不同的荧光探针。8.权利要求1～4任一项所述分子标记或权利要求5～7任一所述特异性引物组的如下任一种应用：(1)在鉴定小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B中的应用；(2)在筛选或鉴定高抗条锈病的小麦品种中的应用；(3)在小麦分子标记辅助育种中的应用；(4)在小麦种质资源改良中的应用。9.一种鉴定小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B的方法，其特征在于，以待测小麦的基因组DNA为模板，采用权利要求5～7任一所述的特异性引物组进行荧光定量PCR扩增，根据PCR扩增结果对待测小麦进行基因分型。10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，含有小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B的小麦品种均出现与SEQIDNO.2所示引物连接的荧光探针相同的荧光信号，而不含有小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B的小麦品种均出现与SEQIDNO.2所示引物连接的荧光探针明显不同的荧光信号。2CN114836556A说明书1/11页与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B紧密连锁的分子标记及应用技术领域[0001]本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及一种与小麦条锈病抗性QTLQYr.sicau‑6B紧密连锁的分子标记KASP‑TXK‑6及应用。背景技术[0002]小麦(TriticumaestivumL.)是世界上重要的粮食作物之一，超过40％的人口以小麦作为主食原料。小麦不管是在农业生产部分还是食品加工领域都占有及其重要的地位，是最主要的粮食作物之一。小麦条锈病是由条锈菌(Pucciniastriifor