裸花紫珠SSR分子标记及其核心引物对、试剂盒和应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114990253A(43)申请公布日2022.09.02(21)申请号202210602997.2C12N15/11(2006.01)(22)申请日2022.05.30(71)申请人中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所地址570100海南省海口市龙华区学院路4号(72)发明人黄梅于福来李鑫陈振夏张红瑞胡璇王凯王丹陈晓鹭谢小丽官玲亮(74)专利代理机构北京久诚知识产权代理事务所(特殊普通合伙)11542专利代理师王晶晶(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)权利要求书5页说明书22页序列表10页附图2页(54)发明名称裸花紫珠SSR分子标记及其核心引物对、试剂盒和应用(57)摘要本发明提供了裸花紫珠SSR分子标记及其核心引物对、试剂盒和应用，属于分子生物学技术领域。本发明从裸花紫珠转录组序列中，开发并筛选出扩增效果好、多态性高的14对SSR分子标记引物，采用上述SSR分子标记引物，可对裸花紫珠进行种质资源遗传多样性评价、聚类分析、构建SSR指纹图谱、分子辅助育种等，对后续裸花紫珠种质资源管理、育种、遗传保护、群体间和群体内的遗传多样性分析具有重要意义。CN114990253ACN114990253A权利要求书1/5页1.一种裸花紫珠SSR分子标记，其特征在于，包括14个SSR分子标记，具体包括：2CN114990253A权利要求书2/5页3CN114990253A权利要求书3/5页其中，n≥5。2.一种裸花紫珠SSR分子标记的核心引物对，其特征在于，包括使用权利要求1的SSR分子标记扩增出的引物对：所述针对SSR分子标记LHZZCnH147扩增的引物序列(5'‑3')为：F:CCGAGGCAAAGTTCCAACCA；R:CCACTGATAAACCAACGAGCC；所述针对SSR分子标记LHZZCnH138扩增的引物序列(5'‑3')为：F:GGCTGTGGTCCAAGAAAGGT；R:AGAAGTTACAGAGCCAAACCA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH182扩增的引物序列(5'‑3')为：F:ATCTCTGTCTCACAAGCGCC；R:CACCGGAACCCTGCATGTAA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH107扩增的引物序列(5'‑3')为：F:ACGCCTTCCATTATGCACGA；R:GCCCGAGTTTGTAGTGGTGA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH220扩增的引物序列(5'‑3')为：F:CCCAAGAAGAGCTGTCCACA；R:CCTCAGCATGCAGAAACTGG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH205扩增的引物序列(5'‑3')为：F:GGTATGTCTCATGTCGCCGA；4CN114990253A权利要求书4/5页R:TTGCGTTCACGATGCTTTGG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH078扩增的引物序列(5'‑3')为：F:AGGCACCTAGCTAGACACCA；R:ACGCTCAGGTAGTTGGTGTG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH275扩增的引物序列(5'‑3')为：F:GAGGCTGGTTTGGAGTGGAA；R:TGTGTCCAAAGGCATCGTGA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH080扩增的引物序列(5'‑3')为：F:ACATCCGGTGCATCCTTTCT；R:TTCCTTCAAGCACCTGTCCC；所述针对SSR分子标记LHZZCnH357扩增的引物序列(5'‑3')为：F:CCCACCAGTGAAAGGCTTCT；R:CGATGTGGGCTGTGATCGTA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH155扩增的引物序列(5'‑3')为：F:CACAGAAACAACACGGCCAG；R:GCGTTTCGACTGCATTCGAT；所述针对SSR分子标记LHZZCnH305扩增的引物序列(5'‑3')为：F:CAGCGCAGGATTGTTGATCA；R:GGGTAAACAGTGGGTGGAGG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH304扩增的引物序列(5'‑3')为：F:ACCAAGCTGCAATTCCCAAG；R:ACCAAATCTTAGGTCCACATCCT；所述针对SSR分子标记LHZZCnH156扩增的引物序列(5'‑3')为：F:GGCCCTGATGCTTCTTCTGT；R:CCTTATAACGCACGCATGGC。3.如权利要求2所述的裸花紫珠SSR分子标记的核心引物对，其特征在于，所述引物正向序列的5'端均标记有荧光基团，所述荧光基团为FAM、HEX或TAMRA。4.一种权利要求2或3