一组茄子InDel分子标记、引物及应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115820917A(43)申请公布日2023.03.21(21)申请号202211526833.2(22)申请日2022.11.30(71)申请人中国农业科学院蔬菜花卉研究所地址100081北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院蔬菜花卉研究所(72)发明人舒金帅刘富中尤园园王帅张映陈钰辉李淑培方莹莹齐诚(74)专利代理机构北京恒律知识产权代理有限公司11416专利代理师任霜(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书2页说明书11页序列表（电子公布）附图3页(54)发明名称一组茄子InDel分子标记、引物及应用(57)摘要本发明属于分子标记开发及分子检测，涉及一组茄子InDel分子标记、引物及应用。本发明开发的茄子InDel分子标记分布在茄子基因组多条染色体上，具有唯一扩增的特点，分型效果好，代表性强，可以实现高通量检测，检测周期短；在进行品种确权或纯度检测时，操作简单快速，检测结果稳定可靠，可根据检测样本和位点数目等实现标记的灵活选择。因此，本发明开发的InDel标记针对不同数目样本量检测可以实现标准化及规模化。CN115820917ACN115820917A权利要求书1/2页1.一组茄子InDel分子标记，其特征在于，所述茄子InDel分子标记包括下表所示的17个核心InDel标记：InDel名称染色体等位变异1等位变异2InDel‑11CCCGAATTCCCTCTTGTTTTGCTGCAAGTAGAATAATAAInDel‑21TTAGGCAATGAATGATGATAGCCCGACTGTAAAGInDel‑31GGTGAAATTTTGATGATTCCATCAGCInDel‑41TTCCTAATTTTTCTCCTATTTGAGCInDel‑53AAATCATGGGAAATAGATAAGTAAATATTAAGTATGATGCTCATInDel‑64GGAAGATGAAGGAGAAAGAATGAAGAInDel‑74AATTTTCAATAGTTCAAGGATATTInDel‑86AAAGATTATCGTAAGGTGAGTTCTTCATTAACATInDel‑96GGCATCTGATTTGGGTTGAGAAAGATGGAAACTAAAGTInDel‑106TTGAAGAAGAAAGACAAAGCATGAGGGTACTTTACAInDel‑117TTTAAATCAACAGTGCAATATGAAAATCAAGInDel‑127CCAGAGATAATAATTACATTCCTAGAInDel‑138TTTGGGAGGGTCTAGTGTTAATACTTGAATGAInDel‑148AAAAATTGAGCTTGInDel‑1510TTAAAACTAGATAAATTATAAInDel‑1611GGAGTGTACGCTGACCTTATTCTTACAInDel‑1712CCTCACAATTGAGGAGTGTTACATTTTGTTTGCTATG。2.根据权利要求1所述的茄子InDel分子标记，其特征在于，所述茄子InDel分子标记参照基因组HQ‑1315确定。3.权利要求1所述InDel分子标记的扩增用引物，其特征在于，InDel‑1的扩增用引物如SEQIDNO.1～2所示，InDel‑2的扩增用引物如SEQIDNO.3～4所示，InDel‑3的扩增用引物如SEQIDNO.5～6所示，InDel‑4的扩增用引物如SEQIDNO.7～8所示，InDel‑5的扩增用引物如SEQIDNO.9～10所示，InDel‑6的扩增用引物如SEQIDNO.11～12所示，InDel‑7的扩增用引物如SEQIDNO.13～14所示，InDel‑8的扩增用引物如SEQIDNO.15～16所示，InDel‑9的扩增用引物如SEQIDNO.17～18所示，InDel‑10的扩增用引物如SEQIDNO.19～20所示，InDel‑11的扩增用引物如SEQIDNO.21～22所示，InDel‑12的扩增用引物如SEQIDNO.23～24所示，InDel‑13的扩增用引物如SEQIDNO.25～26所示，InDel‑14的扩增用引物如SEQIDNO.27～28所示，InDel‑15的扩增用引物如SEQIDNO.29～30所示，InDel‑16的扩增用引物如SEQIDNO.31～32所示，InDel‑17的扩增用引物如SEQIDNO.33～34所示。4.权利要求3所述扩增用引物在制备茄子检测试剂、试剂盒、基因组芯片或液相探针中的应用。5.一种茄子检测产品，其特征在于，所述检测产品包括权利要求3所述扩增用引物，所述产品的类型包括试剂、试剂盒、基因组芯