检测水稻千粒重相关基因特异分子标记的引物组及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927702A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202210886862.3(22)申请日2022.07.26(71)申请人湖北省农业科学院粮食作物研究所地址430064湖北省武汉市洪山区南湖大道3号(72)发明人刘刚卢钰霞邱东峰吴艳焦亚茹王廷宝杨金松焦春海张再君(74)专利代理机构武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)42231专利代理师姜婷(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)C12Q1/6858(2018.01)权利要求书2页说明书12页序列表5页附图3页(54)发明名称检测水稻千粒重相关基因特异分子标记的引物组及其应用(57)摘要本发明公开了检测水稻千粒重相关基因特异分子标记的引物组及其应用，所述引物组包括9组引物对，分别是包括：SNAC1‑3416引物对、qTGW3‑3538引物对、qTGW3‑35390引物对、qTGW3‑35391引物对、qTGW3‑35393引物对、GW5‑5364引物对、GW5‑5366引物对、AET1‑2659引物对和DHD1‑2889引物对。本发明提供的引物组能够在137份来源广泛的籼稻中准确鉴定SNAC1、qTGW3、GW5、AET1和DHD1基因的单倍型，可在育种材料中进行早期鉴定，筛选上述5个基因的优势单倍型组合，提高育种选择效率。CN115927702ACN115927702A权利要求书1/2页1.一种检测水稻千粒重相关基因特异分子标记的引物组，其特征在于，所述相关基因为SNAC1、qTGW3、GW5、AET1和DHD1，所述引物组包括序列如SEQIDNO:1‑3所示的SNAC1‑3416引物对、序列如SEQIDNO:4‑6所示的qTGW3‑3538引物对、序列如SEQIDNO:7‑9所示的qTGW3‑35390引物对、序列如SEQIDNO:10‑12所示的qTGW3‑35391引物对、序列如SEQIDNO:13‑15所示的qTGW3‑35393引物对、序列如SEQIDNO:16‑18所示的GW5‑5364引物对、序列如SEQIDNO:19‑21所示的GW5‑5366引物对、序列如SEQIDNO:22‑24所示AET1‑2659引物对和序列如SEQIDNO:25‑27所示的DHD1‑2889引物对。2.一种包含权利要求1所述引物组的检测试剂盒。3.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在鉴定筛选高千粒重的优势单倍型组合中的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，以待检测水稻基因组DNA为模板，采用权利要求1所述的9组引物对分别进行PCR扩增，用酶标仪对9组PCR产物的荧光信号进行读取以分辨不同的等位变异，从而鉴定待检测的水稻材料中是否含有所述优势单倍型组合。5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述优势单倍型组合为CH1、CH2、CH3、CH4、CH5、CH6、CH7和CH8中的一种，具体如下表所示：单倍型组合单基因单倍型CH1SNAC1‑H1,qTGW3‑H2,GW5‑H1,AET1‑H1,DHD1‑H1CH2SNAC1‑H1,qTGW3‑H2,GW5‑H1,AET1‑H1,DHD1‑H2CH3SNAC1‑H1,qTGW3‑H1,GW5‑H2,AET1‑H2,DHD1‑H1CH4SNAC1‑H1,qTGW3‑H1,GW5‑H2,AET1‑H2,DHD1‑H2CH5SNAC1‑H1,qTGW3‑H2,GW5‑H2,AET1‑H1,DHD1‑H1CH6SNAC1‑H1,qTGW3‑H2,GW5‑H2,AET1‑H1,DHD1‑H2CH7SNAC1‑H2,qTGW3‑H2,GW5‑H2,AET1‑H1,DHD1‑H1CH8SNAC1‑H2,qTGW3‑H2,GW5‑H2,AET1‑H1,DHD1‑H2上表中所述各单基因单倍型的情况具体如下表所示：2CN115927702A权利要求书2/2页6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述优势单倍型组合为CH4。7.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在水稻辅助育种中的应用。8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，对水稻样品进行检测，选择CH4型的水稻样品进行育种。9.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在鉴定高产水稻品种中的应用。10.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在检测水稻品种千粒重性状中的应用。3CN115927702A说明书1/12页检测水稻千粒重相关基因特异分子标记的引物组及其应用技术领域[0001]本发明属于分子育种技术领域，具体涉及一种用于检测水稻千粒重相关基因特异性分子标记的引物组及其在水