检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927703A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202210886863.8(22)申请日2022.07.26(71)申请人湖北省农业科学院粮食作物研究所地址430064湖北省武汉市洪山区南湖大道3号(72)发明人邱东峰刘刚卢钰霞吴艳焦亚茹王廷宝杨金松焦春海张再君(74)专利代理机构武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)42231专利代理师姜婷(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书3页说明书13页序列表2页附图2页(54)发明名称检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组及其应用(57)摘要本发明公开了检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组及其应用，所述包括GS3‑1673引物对、GW5‑5364引物对和GW5‑5366引物对，其中，所述GS3‑1673引物对的序列如SEQIDNO:1‑3所示，所述GW5‑5364引物对的序列如SEQIDNO:4‑6所示，所述GW5‑5366引物对的序列如SEQIDNO:7‑9所示。本发明针对粒型基因GS3和GW5的单倍型进行检测的引物组，能够在168份来源广泛的籼稻中准确鉴定粒型基因GS3和GW5的单倍型，可用于育种材料中的早期鉴定，筛选GS3和GW5的优势单倍型组合，提高育种选择效率。CN115927703ACN115927703A权利要求书1/3页1.一种检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组，其特征在于，包括GS3‑1673引物对、GW5‑5364引物对和GW5‑5366引物对，其中，所述GS3‑1673引物对的序列如SEQIDNO:1‑3所示，所述GW5‑5364引物对的序列如SEQIDNO:4‑6所示，所述GW5‑5366引物对的序列如SEQIDNO:7‑9所示。2.一种包含权利要求1所述引物组的检测试剂盒。3.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在鉴定筛选长粒、宽粒、大长宽比和高千粒重的优势单倍型组合中的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，以待检测水稻基因组DNA为模板，采用权利要求1所述的3组引物对分别进行PCR扩增，用酶标仪对3组PCR产物的荧光信号进行读取以分辨不同的等位变异，从而鉴定待检测的水稻材料中是否含有所述优势单倍型组合。5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述优势单倍型组合为CH1、CH2、CH3和CH4中的一种，所述CH1为GS3‑H1和GW5‑H1的组合，所述CH2为GS3‑H1和GW5‑H2的组合，所述CH3为GS3‑H2和GW5‑H1的组合，所述CH4为GS3‑H2和GW5‑H2的组合；其中，所述GS3‑H1、GS3‑H2、GW5‑H1、GS5‑H2的具体情况如下表所示：2CN115927703A权利要求书2/3页6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述优势单倍型组合为CH1。7.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在水稻辅助育种中的应用。8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，对水稻样品进行检测，选择CH1型的水稻样品进行育种。3CN115927703A权利要求书3/3页9.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在检测水稻粒型性状中的应用。10.如权利要求1所述的引物组或如权利要求2所述的检测试剂盒在鉴定高产水稻品种中的应用。4CN115927703A说明书1/13页检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组及其应用技术领域[0001]本发明属于分子育种技术领域，具体涉及一种用于检测水稻粒型基因GS3和GW5特异分子标记的引物组及其应用。背景技术[0002]水稻粒型是水稻重要的外观品质性状，包括籽粒长度、宽度、厚度以及长宽比，它会直接决定籽粒的重量，从而对水稻产量也具有重要作用。水稻粒型是一个复杂的遗传性状，是受多基因控制的数量性状，截至目前为止，已经有超过400个粒型相关的QTL被检测到(Huangetal.2013)，学者通过不同的方式进行了粒型QTL的定位与克隆，包括GS3、GW5、GW2、GS5、qGL3、GW8、GS2、GL7、GLW7等(Fanetal.,2006；Wengetal.,2008；Liuetal.2017；Songetal.,2007；Lietal.,2011；Qietal.,2012；Wangetal.,2012；Huetal.2015；Duanetal.2015；Wangetal.,2015；Sietal.,2015)。GS3是水稻中第一个被图位克隆的粒型基因，它会显著的影响粒长和千粒重并会微弱的影响粒宽和粒厚，G