与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115976256A(43)申请公布日2023.04.18(21)申请号202211276633.6C12Q1/686(2018.01)(22)申请日2022.10.18C12N15/11(2006.01)(66)本国优先权数据202210005702.32022.01.04CN(71)申请人东北农业大学地址150030黑龙江省哈尔滨市香坊区长江路600号(72)发明人姜景彬杨欢欢张一尧许向阳李景富赵婷婷张贺王傲雪陈秀玲(74)专利代理机构重庆律知诚专利代理事务所(普通合伙)50281专利代理师殷兴旺王俊超(51)Int.Cl.权利要求书1页说明书4页C12Q1/6895(2018.01)序列表（电子公布）附图1页(54)发明名称与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记及其应用(57)摘要本发明属于分子标记技术领域，具体涉及与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记及其应用。本发明鉴定得到一个与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记，其序列如SEQIDNo.1和/或SEQIDNo.2所示。该标记可以在番茄苗期快速鉴定叶片夹角大小的番茄株型情况，不需要等到番茄生长后期株型稳定，可以大大加快番茄夹角小、株型紧凑种质资源的选育进程。可用于番茄株型分子标记辅助选择育种，也将大大缩短番茄育种进程，对番茄株型改良提供实践依据。CN115976256ACN115976256A权利要求书1/1页1.与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记，其特征在于，其序列如SEQIDNo.1和/或SEQIDNo.2所示。2.扩增权利要求1所述SCAR标记的引物对，其特征在于，其序列如SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示。3.权利要求1所述SCAR标记或权利要求2所述引物对在番茄育种中的用途。4.权利要求1所述SCAR标记或权利要求2所述引物对在鉴定番茄叶夹角大小中的用途。2CN115976256A说明书1/4页与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记及其应用技术领域[0001]本发明属于分子标记技术领域，具体涉及与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记及其应用。背景技术[0002]20世纪60年代，Donald(1968)提出了理想株型的概念，即田间竞争最小的株型，能最大限度的提升光能利用率，从而达到增加产量的目的。叶夹角指叶柄与主茎的夹角，是株型的主要构成要素。叶夹角对株型的构成主要影响株幅，通常叶夹角越小，株幅也就越小，可以提高植株的光合利用效率和种植密度，以达到提升单位面积的番茄产量的目的。目前，虽然刘星雨等(2020)已经精确定位了两个位于番茄10号染色体的番茄叶夹角主效QTL(LA1‑1和LA1‑2)，奠定了我国深入研究番茄叶夹角形成的遗传机理的基础，但我国关于株型育种的研究依然集中在玉米、小麦等大田作物上。有关番茄株型，尤其是叶夹角的研究主要集中于田间管理以及转基因育种领域。传统育种方法针对番茄株型的筛选较为困难，效率低，而结合分子标记技术对番茄株型叶夹角性状进行的早期鉴定方法尚未见报道。[0003]分子标记辅助育种，是指结合分子标记技术筛选并明确个体是否含有目的基因。其特点是利用个体DNA序列进行选择，从而规避环境等因素对植物生长过程的影响，使选育得到的种子更具有遗传稳定性。采用筛选基因性状的方式可以提高育种效率，加快育种的进程。SCAR标记是由RAPD，RFLP，SSR等分子标记转化得到的一种分子标记，由于其无需酶切、简单高效、可重复性好等特点，已经成为分子标记辅助育种的首选标记。开发用于番茄植株叶夹角早期鉴定的SCAR标记具有重要的实际应用价值。发明内容[0004]本发明要解决的技术问题是为番茄株型的早期筛选提供一种新选择。[0005]本发明的技术方案是与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记，其序列如SEQIDNo.1和/或SEQIDNo.2所示。[0006]本发明还提供所述SCAR标记的扩增引物对，其序列如SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示。[0007]本发明还提供了所述SCAR标记或引物对在番茄育种中的用途。[0008]本发明还提供了所述SCAR标记或引物对在鉴定番茄叶夹角大小中的用途。[0009]本发明有益效果：本发明鉴定得到一个与番茄叶夹角大小紧密连锁的SCAR标记。该标记可以在番茄苗期快速鉴定叶片夹角大小的番茄株型情况，不需要等到番茄生长后期株型稳定，可以大大加快番茄夹角小、株型紧凑种质资源的选育进程。此外，该SCAR标记引物不需要酶切，只需要PCR一步法检测，检测成本低、准确率较高等优点，可较好的用于番茄节间株型分子标记辅助选择育种，通过提取番茄叶片、茎、根等植株中任意可取材的器官或组织的DNA，然后通过PCR的方法准确地对番茄叶片夹角大小进行鉴定，该发明提供的技