与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN106701931A(43)申请公布日2017.05.24(21)申请号201611155670.6(22)申请日2016.12.14(71)申请人中国水产科学研究院珠江水产研究所地址510380广东省广州市荔湾区西朗兴渔路1号(72)发明人李胜杰樊佳佳姜鹏王俊杰胡婕(74)专利代理机构广州嘉权专利商标事务所有限公司44205代理人郑莹胡辉(51)Int.Cl.C12Q1/68(2006.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书4页序列表4页(54)发明名称与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用(57)摘要本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQIDNO.1、SEQIDNO.2或SEQIDNO.3所示；所述SEQIDNO.1自5’端起第658位碱基为C或A，CC个体的生长速度显著高于AA个体；所述SEQIDNO.2自5’端起第327位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体；所述SEQIDNO.3自5’端起第121位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用，可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性，可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。CN106701931ACN106701931A权利要求书1/1页1.与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记，所述SNP标记分别如SEQIDNO.1、SEQIDNO.2或SEQIDNO.3所示；所述SEQIDNO.1自5’端起第658位碱基为C或A；所述SEQIDNO.2自5’端起第327位碱基为A或G；所述SEQIDNO.3自5’端起第121位碱基为A或G。2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQIDNO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长速度显著高于AA基因型个体。3.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQIDNO.2的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。4.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQIDNO.3的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。5.权利要求1-4任一项所述的SNP标记在检测大口黑鲈“优鲈1号”样本生长性状中的应用。6.用于快速检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的引物对。7.根据权利要求6所述的引物对，其特征在于，用于检测SEQIDNO.1所示SNP标记的引物对如SEQIDNO.4和SEQIDNO.5所示；用于检测SEQIDNO.2所示SNP标记的引物对如SEQIDNO.7和SEQIDNO.8所示；用于检测SEQIDNO.3所示SNP标记的引物对如SEQIDNO.10和SEQIDNO.11所示。8.一种用于筛选快速生长大口黑鲈样本的试剂盒，其包括权利要求6或7所述的引物对。9.一种快速生长大口黑鲈样本的筛选方法，其特征在于，通过对大口黑鲈样本SEQIDNO.1、SEQIDNO.2或SEQIDNO.3SNP标记的检测，选择SEQIDNO.1SNP标记为CC基因型和/或SEQIDNO.2SNP标记为AA基因型和/或SEQIDNO.3SNP标记为AA基因型的个体。10.根据权利要求9所述的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：（1）提取待检样品基因组DNA；（2）以提取得到的DNA为模板，利用权利要求6或7所述的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；（3）对PCR扩增产物进行测序，根据测序结果确定样品的SNP标记的基因型来筛选快速生长样本。2CN106701931A说明书1/4页与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用技术领域[0001]本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。背景技术[0002]大口黑鲈(MicropterussalmoidesL.)，俗名加州鲈，原产于北美洲，具有生长快、耐低温、肉质鲜美和易捕捞等特点，是重要的淡水养殖鱼类之一。1983年从台湾引种到广东省，现在全国大部分地区均有养殖。然而，目前我国养殖的大口黑鲈是由野生种家养驯化而成的，缺少定向选育，在亲本留种时经常选择个体小，性成熟早的个体作为亲本，致使我国大口黑鲈种质的下降，主要表现在生长速度下降、性成熟年龄普遍提前、饵料转化效率低、抗病力也大幅下降，其中，生长速度关系到大口黑鲈产量的高低，养殖效益的大小。养殖大口黑鲈生长速度慢、产量低直接影响大口黑鲈养殖业的健康稳定发展。因此，从分子遗传学角度加快改良大口黑鲈，提高其生长性能的工作势在必行。[0003]大口黑鲈“优鲈1号”养殖新品种是以国