一种水稻粒宽基因GW2的分子标记及其应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN107058516A(43)申请公布日2017.08.18(21)申请号201710139181.X(22)申请日2017.03.09(71)申请人海南波莲水稻基因科技有限公司地址570125海南省海口市紫荆路2-1号紫荆信息公寓26A(72)发明人黄培劲龙湍李佳林唐杰刘昊李新鹏张维安保光曾翔吴永忠(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002代理人王文君(51)Int.Cl.C12Q1/68(2006.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表1页附图1页(54)发明名称一种水稻粒宽基因GW2的分子标记及其应用(57)摘要本发明提供了一种水稻粒宽基因GW2的分子标记和应用，属于植物生物技术领域。本发明的分子标记通过两条正向引物和一条反向引物PCR扩增得到，前述引物的核苷酸序列分别如SEQIDNO.1-3所示。利用该水稻粒宽基因GW2的分子标记，只需通过简单的PCR即可完成对GW2的基因分型，预测水稻粒宽变异。本发明具有操作简便、分型快速、结果准确、成本低廉等优势，能提高性状选择效率，满足大规模分子标记辅助选择的需求。CN107058516ACN107058516A权利要求书1/1页1.一种水稻粒宽基因GW2的分子标记，其特征在于，通过核苷酸序列如SEQIDNO.1-3所示的引物扩增得到。2.权利要求1所述的分子标记在鉴定水稻粒宽基因GW2基因型中的应用。3.权利要求1所述的分子标记在水稻育种中的应用。4.用于检测水稻粒宽基因GW2的特异性引物组合，其特征在于，含有核苷酸序列如SEQIDNO.1-3所示的引物。5.权利要求4所述的特异性引物组合在鉴定水稻粒宽基因GW2基因型中的应用。6.权利要求4所述的特异性引物组合在水稻种质资源改良中的应用。7.检测水稻粒宽基因GW2基因型的方法，其特征在于，对待测样本提取基因组DNA后，利用SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示的正向引物、SEQIDNO.3所示的反向引物进行PCR，对PCR扩增产物大小进行分析，根据PCR产物大小确定GW2的基因型；若扩增产物只出现88bp条带，则表明待测样品的GW2基因为野生型；若只出现81bp条带，则表明待测样品的GW2基因为突变型；若同时出现88bp和81bp条带，则表明待测样品的GW2基因为杂合型。8.一种检测水稻谷粒宽度的方法，其特征在于，对待测样本提取基因组DNA后，利用SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示的正向引物、SEQIDNO.3所示的反向引物进行PCR，对PCR扩增产物大小进行分析，根据PCR产物大小推测水稻粒宽变化；若扩增产物只出现88bp条带，则表明待测样品的谷粒较窄；若只出现81bp条带，则表明待测样品的谷粒较宽；若同时出现88bp和81bp条带，则待测样品的粒宽处于两亲本之间。9.如权利要求7或8所述的方法，其特征在于，PCR的反应体系为：Biomiga的2×BenchTopTMTaqmastermix5μL，10μM的两个正向、一个反向引物各0.5μL，10％DMSO0.5μL，模板DNA约50-100ng，补灭菌ddH2O至10μL；PCR反应条件为：94℃，4min；94℃，30s，60℃，30s，72℃，20s，共35个循环；72℃，5min，16℃，1min。10.含有权利要求4所述的特异性引物组合的试剂盒。2CN107058516A说明书1/5页一种水稻粒宽基因GW2的分子标记及其应用技术领域[0001]本发明属于植物生物技术领域，具体地说，涉及一种水稻粒宽基因GW2的分子标记及其应用。背景技术[0002]我国是最主要的水稻生产与消费大国，在过去的几十年间，水稻产量翻了几番，水稻产量相关基因的研究也取得巨大突破，包括qGL3、GW2、qSW5/GW5、GS3、GS5、GW8等基因相继被克隆。水稻的产量主要取决于穗数、每穗粒数和粒重，而粒重则主要由粒形的长、宽、厚三个基本性状决定。在构成水稻产量的三要素中，粒重(通常用千粒重表示)的遗传比较稳定，同时，由于粒重又与水稻的外观品质和蒸煮食味品质等存在着密切的关系，因而一直倍受水稻育种家和科研工作者的重视。[0003]水稻GW2是Song等(SongXJ,HuangW,ShiM,etal.AQTLforricegrainwidthandweightencodesapreviouslyunknownRING-typeE3ubiquitinligase.NatureGenetics,2007,39:623-630)克隆到的一个控制粒宽和粒重的主效基因。其功能性碱基突变为宽粒水稻的GW2等位基因在第四外显子上缺失了一个A，导致蛋白翻译提前终止，丢失31