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本发明公开了调控玉米根系夹角和倒伏抗性的基因及其应用。所述调控玉米根系角度和倒伏抗性的关键基因为ZmYUC2和ZmYUC4。其中ZmYUC2的编码区多核苷酸序列为SEQIDNo:1或SEQIDNo:3所示,ZmYUC4的编码区多核苷酸序列为SEQIDNo:5所示,本发明所提供的调控玉米气生根角度和倒伏抗性的基因能够特异的调控根尖局部的生长素合成,进而调控玉米根系的夹角,对其余农艺性状不造成不利影响,进而可应用于玉米根系角度和抗倒伏育种。