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本发明涉及了一种基于CRISPR/Cas9变换水稻果皮色(白至红、红至白)的基因编辑方法,其包括如下步骤:(1)合成转录因子rc基因的特定gRNA?spacer;(2)构建CRISPR/Cas?gRNA?spacer载体;(3)采用农杆菌转化法转化水稻品种的成熟胚、再生植株。T0代种子即可实现水稻品种果皮色的白至红、红至白的相互转变。红米在世界各国长期用作滋补食品,是水稻育种的重要目标之一。经过人工长期驯化的水稻果皮色为白色,抗性弱,而来自栽培稻脱驯化的杂草稻果皮色为红色,抗性强。通过相互转换果皮色,可能培育出抗性强的白\红果皮水稻品种。本技术具有良好的商业化应用前景。