用于微集落生长和微生物细胞表征的系统和方法.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113728110A(43)申请公布日2021.11.30(21)申请号201980092806.9杉耶史·雅索萨澜蒂(22)申请日2019.12.20诺·艾拉维尔阿拉莱·萨米埃(30)优先权数据(74)专利代理机构北京英赛嘉华知识产权代理62/784,2342018.12.21US有限责任公司1120462/928,9352019.10.31US代理人王达佐洪欣(85)PCT国际申请进入国家阶段日(51)Int.Cl.2021.08.17C12Q1/24(2006.01)G01N33/52(2006.01)(86)PCT国际申请的申请数据C12M1/00(2006.01)PCT/CA2019/0518952019.12.20C12M1/26(2006.01)(87)PCT国际申请的公布数据C12M1/34(2006.01)WO2020/124271EN2020.06.25C12N1/00(2006.01)(71)申请人克维拉公司C12N5/00(2006.01)地址加拿大安大略省C12Q1/00(2006.01)C12Q1/02(2006.01)(72)发明人萨马德·泰勒普尔C12Q1/04(2006.01)罗伯特·马斯坎特耶耶·凯尼G01N1/28(2006.01)斯蒂芬·韦斯利·伦纳德G01N1/40(2006.01)维里西·帕尔马安娜·希姆琴科G01N33/483(2006.01)玛丽亚姆·阿萨迪谢卡里苏克德夫·曼库权利要求书16页说明书61页附图56页(54)发明名称细胞的生长或抑制。用于微集落生长和微生物细胞表征的系统和方法(57)摘要采用集成流体装置进行微生物细胞分离，原位微菌落生长，以及任选的鉴定和抗微生物易感性测试。当集成流体装置保持在关闭状态时，执行微生物细胞分离以提供与固相生长培养基接触的微生物细胞悬浮液。除去悬浮液的液体组分，从而将微生物细胞保留在生长培养基上，用于孵育、生长和随后的收获和表征。在一些实施方案中，通过使生长培养基与具有提供于其上的抗微生物剂的固体支持物接触来进行抗微生物剂敏感性测试，使得抗微生物剂扩散到生长培养基的子区域中，所述子区域通过至少部分地被固体支持物包围的孔可进入。在存在抗微生物剂的CN113728110A情况下，可以评估保留在子区域表面上的微生物CN113728110A权利要求书1/16页1.一种处理含有微生物细胞的样品的方法，所述方法包含：将所述样品引入集成流体装置，所述集成流体装置包含样品处理模块和生长模块；在将所述集成流体装置保持在关闭状态以防止外部微生物细胞进入时：在所述样品处理模块内处理所述样品以从所述样品分离所述微生物细胞并获得微生物细胞悬浮液，所述微生物细胞悬浮液包含悬浮在液体内的所述微生物细胞；将所述微生物细胞悬浮液从所述样品处理模块输送到所述生长模块，使得所述微生物细胞悬浮液接触存在于所述生长模块内的固相生长培养基，所述固相生长培养基被配置为促进微生物细胞生长；从所述微生物细胞悬浮液去除所述液体的至少一部分，使得至少一种微生物细胞保留在所述固相生长培养基的表面上；以及在适于促进集落生长的条件下孵育至少所述生长模块。2.根据权利要求1所述的方法，其中通过所述固相生长培养基吸收所述液体的所述至少一部分来去除所述液体的所述至少一部分。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述液体是第一液体并且所述固相生长培养基是基于凝胶的培养基，所述方法进一步包含在使所述微生物细胞悬浮液与所述固相生长培养基接触之前，使所述集成流体装置经受离心力，以从所述固相生长培养基去除第二液体，从而获得部分脱水的固相生长培养基，使得当所述微生物细胞悬浮液与所述部分脱水的固相生长培养基接触时，所述第一液体的所述至少一部分通过所述部分脱水的固相生长培养基的吸收而去除。4.根据权利要求3所述的方法，其中所述离心力的范围在1,000g与10,000g之间。5.根据权利要求3或4所述的方法，其中在所述样品处理模块内处理所述样品以根据基于离心分离的分离方法从所述样品分离所述微生物细胞，并且其中在所述基于离心分离的分离方法期间向所述固相生长培养基施加所述离心力。6.根据权利要求3至5中任一项所述的方法，其中在离与所述固相生长培养基的表面相关联的表面法线小于30度的方向上施加所述离心力。7.根据权利要求3至5中任一项所述的方法，其中在垂直于所述固相生长培养基的表面的方向上施加所述离心力。8.根据权利要求3至7中任一项所述的方法，其中接触所述微生物细胞悬浮液的所述表面是第一表面，所述固相生长培养基进一步包含与所述第一表面相对的第二表面，施加所述离心力使得所述第二液体从邻近所述第二表面的区域移除。9.根据权利要求3至7中任一项所述的方法，其