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本发明公开了一种创制高萝卜硫苷含量芥蓝种质的方法,涉及农业育种领域;包括以下步骤:(1)母本的选育:中花芥蓝?2自交留种,进行纯化,经连续自交6代获得萝卜硫苷含量大于0.2μmol/g的自交系;(2)父本的选育:矮脚香菇?2进行自交留种,每年都从中选择表现优良的单株自交留种,不断地进行自交纯化,经连续自交10代育成萝卜硫苷含量大于0.2μmol/g的自交系;(3)杂种一代的选育:以步骤(1)获得的自交系为母本,步骤(2)获得的自交系为父本进行杂交,获得杂种一代,即为该高萝卜硫苷含量芥蓝种质。本发明培育出的高萝卜硫苷含量芥蓝种质的抗癌硫苷RAA含量高,达到了3.18μmol/gFW。