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本发明涉及生物饲料技术领域,特别涉及一种多菌种发酵椰蓉制备生物饲料的方法。该方法包括:将椰蓉和豆粕的混合物作为发酵底物,采用酿酒酵母菌、枯草芽孢杆菌组成混合菌种进行有氧发酵2~5天,再添加植物乳杆菌对发酵底物进行厌氧发酵5~15天,通过两步固态发酵从而得到发酵椰蓉生物饲料。三种菌种的活菌数比例为(27~54):(1.9~5.7):36。本发明发酵饲料具有发酵香味,因此能提高畜禽的采食量。通过微生物发酵技术开发海南当地特色的地源性饲料,另外海南属于热带地区,微生物种类繁多,气候适合微生物生长,代谢能力强,能在短时间内能把大量的地源性农业废弃物转化为有用的发酵饲料,从而减少生产开发成本。