混合检材分析微单倍型复合扩增体系及构建及单倍型频率.pdf
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混合检材分析微单倍型复合扩增体系及构建及单倍型频率.pdf
本发明提供了一种混合检材分析中微单倍型复合扩增体系的构建方法及相关单倍型频率。本发明提供了一组遗传标记组合共计18个微单倍型及其rs号。根据18个微单倍型的扩增引物,构建了用于混合检材分析的微单倍型复合扩增体系。本文还提供了包括前述18个微单倍型的扩增引物的试剂盒。本发明提供的微单倍型复合扩增体系可以对混合检材进行法医学鉴定,且灵敏度高,识别能力强。
29个微单倍型位点、筛选方法、复合扩增体系及应用.pdf
本发明公开了一种29个微单倍型位点、筛选方法、复合扩增体系及应用。本发明通过获取群体数据,再从中获取微单倍型基因型、等位基因频率,计算出候选位点在不同人群中的法医学相关参数,再将影响后续测序分型的位点进行排除后,得到29个微单倍型位点;根据该29个微单倍型位点设计引物、扩增条件并建立三轮PCR扩增体系为基础的复合扩增体系,该复合扩增体系对混合生物检材中提取到的DNA模板进行扩增,并将扩增结果进行大规模并行测序,获得各微单倍型位点在DNA模板中测序深度的数值,最终达到对混合生物检材的分型目的。本发明复合扩增
一种单倍型的构建方法.pdf
本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及一种单倍型的构建方法,所述构建方法包括以下步骤:针对目的基因设计多对PCR引物,以使扩增后相邻两条PCR产物具有重叠区域,且所有PCR产物能完全覆盖目的基因;利用设计的PCR引物扩增目的基因;以扩增得到的所有PCR产物为模板进行长读长二代测序文库构建并上机测序;数据分析:通过组装获得目的基因的单倍型信息。可以利用现有的长读长二代测序技术实现目标区域的靶向单倍型检测,极大地提高现有的长读长二代测序技术的应用范围;此外,也在靶向测序领域实现了单倍型检测的可能;以更低的成
群体单倍型可视化分析方法及系统.pdf
本发明提供一种群体单倍型可视化分析方法及系统,该分析方法包括:利用Excel文档显示聚类树、样本信息以及每个样本的每个多态性位点的基因型矩阵,并采用不同颜色显示每个窗口标准化深度。可视化分析系统,包括:输入模块,用于将待分析的群体单倍型文件输入,所述群体单倍型文件包括:变异位点文件、比对文件、样本信息数据;分析模块,用于获取聚类树和计算标准化测序深度;可视化模块,根据分析模块提供的聚类树和标准化测序深度,通过Excel表格绘制并显示聚类树、基因型矩阵、标准化测序深度热图,并显示样本信息和变异注释信息。本发
一种构建牡蛎单倍型基因组的方法.pdf
本发明属于海洋生物基因组和分子遗传学领域,具体涉及到一种构建牡蛎单倍型基因组的方法。选取一个牡蛎雄性和一个雌性个体,人工构建全同胞家系并对后代进行常规养殖;将父本和母本个体分别进行高通量测序,鉴定父本特异性单核苷酸变异位点和母本特异性单核苷酸变异位点;后代个体养殖一年后,取一个体进行高通量测序;利用双亲特异性单核苷酸变异位点对后代个体的测序序列进行分组,获得父源后代序列和母源后代序列;将父源和母源后代序列分别进行组装,获得父源和母源单倍型基因组。应用该方法获得长牡蛎和福建牡蛎高质量单倍型基因组,BUSCO