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一种显微镜系统包括被设置用于拍摄全景图像(11)的显微镜(1)和计算设备(20),该包括被训练用于图像分割的模型(20B),该模型基于全景图像(11)计算分割掩码(21)。计算设备(20)使通过参数化模型(P)描述的图案(M)适配于分割掩码(21)。借助于适配的图案(M)产生更新的分割掩码(31)。此外,描述了一种用于图像分割的方法,该方法以相应的方式适配图案(M)。